在外部函数调用中出现NA/NaN/Inf (第5个参数)。

Question

我不知道是否需要清除一些数据，或者出了什么问题。 模型1和2运行得非常好。模型3无法运行。

model1 <- clogit(Used ~ Slope + strata(OBJECTID), data=old)

model2 <- clogit(Used ~ Aspect + strata(OBJECTID), data=old)

model3 <- clogit(Used ~ Slope + Aspect + strata(OBJECTID), data=old)

Model 3出现了以下错误：

> Error in fitter(X, Y, strats, offset, init, control, weights =
> weights,  :    NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 5)

此外，它还会提供以下警告：

> In fitter(X, Y, strats, offset, init, control, weights = weights,  :  
> Ran out of iterations and did not converge

我不太关心警告，因为其他模型也会出现这种情况，但它们实际上是有输出结果的。

如果需要，我可以发布数据；或者如果您有指导方向的想法，那就太棒了。

-丹

****** 附加信息 ******* RPackages：生存分析。

> o.s.model <- clogit(Used ~ Slope + strata(OBJECTID), data=old)
> o.a.model <- clogit(Used ~ Aspect + strata(OBJECTID), data=old)
> o.sa.model <- clogit(Used ~ Slope + Aspect + strata(OBJECTID), data=old)
Error in fitter(X, Y, strats, offset, init, control, weights = weights,  : 
  NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 5)
In addition: Warning message:
In fitter(X, Y, strats, offset, init, control, weights = weights,  :
  Ran out of iterations and did not converge
> 

Slope和Aspect都是数字。

数据集位于：https://drive.google.com/file/d/1AXKMJnDs_JYZmy_gB3IaMXHL34_ejxz3/view?usp=sharing

- Dan Graham

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没有可重现的示例，我们无法帮助您。请使用dput提供一个最小的可重现示例。 - Vincent Guyader

你的层有多小？可能两个变量都完美匹配其中一个，而clogit期望完美匹配是不可能的（并将某些内容除以误差，导致inf）。 - Pdubbs

数据每层只有3个点，一个已知位置和2个随机点。 - Dan Graham

@Pdubbs，有没有办法进行搜索，而不是直接删除数据并尝试重新开始？ - Dan Graham

所以...我发现数据文件中有一个问题，而原始文件中没有。抱歉。希望这可以解决问题。 - Dan Graham

Answer 1

这可能是由于数据集中存在相关性引起的。尝试使用Efron或Breslow逼近方法(method='efron')拟合模型，对我来说解决了这个问题...

另请参见：https://stats.stackexchange.com/questions/109222/conditional-logistic-regression-model-does-not-converge-but-logistic-regression

- jayathecat