pyvis：有没有办法禁用物理效果而不失去图形布局？

Question

我正在尝试使用pyvis可视化一个大型网络，并遇到两个问题：

1. 渲染时间过长
2. 网络不稳定，即节点移动太快，很难与这样的网络进行交互。

通过使用toggle_physics(False)禁用物理特性可以加速渲染并使网络静态化，但会导致布局设置被消除。禁用物理特性后它看起来像这样： link。如您所见，图形混乱且没有结构。

我想要做的是禁用物理特性，但保留布局设置，即我希望我的图形看起来像普通网络（例如networkX中的弹簧布局），并考虑每条边的权重。有没有办法实现这一点？

到目前为止，我发现pyvis只有分层布局，这不是我需要的。我认为整合networkX布局可能会有所帮助，但我不知道该怎么做，因为networkX允许在nx.draw()函数中将布局设置为关键字参数，这与我的情况不兼容。以下是我的代码，如果有助于理解我的问题：

g = nx.Graph()
edges_cards = cards_weights_df.values.tolist()
g.add_weighted_edges_from(edges_cards)

net = Network("1000px", "1800px")
net.from_nx(g)
net.toggle_physics(False)
net.show("graph.html")

感谢您的帮助！

- Margarita Vartanian

Answer 1

您可以将x和y坐标传递给pyvis节点（请参见此处的文档）。 然后，您可以使用networkx创建图形布局，并将结果位置传递给pyvis图形。下面是一个示例，应用了nx.circular_layout()到karate俱乐部网络：

import networkx as nx
from pyvis.network import Network

G = nx.karate_club_graph()
pos=nx.circular_layout(G,scale=500)

net = Network()
net.from_nx(G)

for node in net.get_nodes():
  net.get_node(node)['x']=pos[node][0]
  net.get_node(node)['y']=-pos[node][1] #the minus is needed here to respect networkx y-axis convention 
  net.get_node(node)['physics']=False
  net.get_node(node)['label']=str(node) #set the node label as a string so that it can be displayed

net.toggle_physics(False)
net.show('net.html')

这里是圆形布局的结果： 没有任何特定的布局：

import networkx as nx
from pyvis.network import Network

G = nx.karate_club_graph()

net = Network()
net.from_nx(G)

for node in net.get_nodes():
  net.get_node(node)['physics']=False
  net.get_node(node)['label']=str(node)

net.toggle_physics(False)
net.show('net.html')

- jylls