用Java调用R - 比RCaller更快的替代方案

Question

我尝试使用RCaller 2.0从Java调用R函数，经过几次尝试成功了。整合很容易，但是在运行时RCaller比较慢。我担心由于我需要重复调用相同的脚本数千次，并且由此引入的延迟对我的需求来说无法接受，所以RCaller 2.0不适合我的应用程序。

有没有更快的（就运行时间而言）从Java调用R脚本的替代方法？

- Marsellus Wallace

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我假设你已经了解rJava。有什么原因它不适合吗？ - Ian Fellows

我从未将Java/R集成在一起，而RCaller 2.0似乎是最简单的解决方案。我听说过rJava和Rserve，你会推荐哪一个？还有关于Renjin的工作正在进行中，但可能还为时过早。 - Marsellus Wallace

Answer 1

请查看RCaller源代码树中的测试文件： https://code.google.com/p/rcaller/source/browse/RCaller/src/test/java/rcaller/RunOnlineTest.java 这个测试文件包含了在单个R进程上运行的顺序命令。这种方式被认为是快速的。

- phpcoder

Answer 2

Rcaller在2.1版本中进行了多项性能改进。它现在支持使用单个R进程将命令传递给R，从而在循环中执行。也就是说，在初始化过程之后不再需要系统调用。

- jbytecode

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这个链接可以帮助更快地解决问题。 - jbytecode

Answer 3

有没有办法将一些迭代推到 R 中，这样你就不用经常调用它了？也许你可以传入一个数据数组和一个要运行的脚本数组，现在你是逐个传入它们。

- Ed Staub

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这通常是在系统之间进行交互时采用的一种好方法，因为每次调用的成本往往比传输更多数据的成本高得多。 - obfuscation

@Ed：没错，但是我对 R 脚本没有完全的控制（而且我对 R 一无所知），所以这可能对我是个问题。此外，如果出现任何问题，我将失去对异常处理的完全控制权，这是有风险的。 - Marsellus Wallace

@Ed：嗯...这实际上是我的最终实现，它显著提高了总执行时间。在运行时，RCaller无法击败rJava和rServe，但其简单性在这次发挥了重要作用。Rnjine可能很快就成为前进的道路：http://stdioe.blogspot.com/2011/09/embedding-r-in-java-applications-using.html； - Marsellus Wallace

Answer 4

试试Renjin吧，至少看起来它很快！

- Makoto