在R中关于S4对象、方法和编程的资源

Question

由于我经常面临需要使用S4编程以保持概览的情况，因此我已经收集了相当多关于S4对象、方法和编程的资料。在此作为参考列出。请添加您自己的资源。

在线资源

• The methods help files : methods包中的帮助文件，很多必要信息都可以在这里找到。
• 15页介绍 S4 类 : 简短介绍 S4 对象编程。
• S4 方法是如何工作的？ : 更多关于其底层机制的解释。
• S4 的简明介绍 : 包含构建类的实用示例和一些有用的技巧。其附录提供了方便的概览，但也包含了一些错误。使用时应注意。
• R 中的面向对象编程 : 关于S3和S4的实用示例的讲义笔记。
• S4 对象 : Thomas Lumley 关于 S4 对象的演示。
• R面向对象编程 : R中面向对象编程的深度介绍。它涵盖了S3、S4和S4引用类。相应的 sequences 包实现了幻灯片中使用的类系统。

书籍

• 数据分析软件-R编程（J. Chambers）：这是一本经典著作，虽然并非所有人都对其评价积极，但其中有大量关于S4的内容。
• R语言在生物信息学中的应用（R. Gentleman）：专门针对在Bioconductor中工作的人，它完全基于S4。但它提供了广泛的概述，对许多其他人也很有用。

PS：如果有人找到了社区复选框，可以将此帖子变成社区所有。但我在编辑窗口中找不到它...

- Joris Meys

---

直接在方法包中添加帮助主题的链接怎么样？它们只有几个，对于快速参考非常有用。顺便说一下，“s4简介”末尾有一个备忘录，在我看来值得指出。我正在将其用作参考卡片。 - VitoshKa

现在用户可以使用社区维基了，前提是至少有10,000的声望值。所以可以在聊天中询问Dirk或Shane ;) - Marek

我不建议阅读《S4简明教程》——它中有大量错误。 - hadley

@Marek：如果有足够多的人编辑它，它也会自动变成社区维基。 - Ari B. Friedman

Answer 1

我对S4的撰写（仍在进行中）可以在这里找到：http://adv-r.had.co.nz/S4.html

- hadley

Answer 2

R for programmers (Matloff)（免费）和Introduction to scientific programming and simulation (Jones)都有关于“新式”S4类的简短章节，涉及到IT技术。

- Roman Luštrik

Answer 3

约翰·钱伯斯（John Chambers）的另一本好书是《使用数据编程：S语言指南》。正如其名称所示，它实际上是关于S语言而不是R语言，但它提供了很多有价值的关于S4类的信息。

此外，在R手册“编写R扩展”和“R内部”中也有一些信息（特别是后者）。这些可以在http://cran.r-project.org/doc/manuals/找到。

最后，我建议阅读“S4方法的工作原理”，它是一个关于如何思考S4如何适用于R的绝佳概述。

- Eli Sander