如何在没有Matlab数据库工具箱的情况下从Matlab访问PostgreSQL数据库？

Question

我已经尝试使用pgmex。不幸的是，它无法与libpq5配合使用（matlab立即崩溃）。

- Philipp der Rautenberg

Answer 1

如果不使用数据库工具箱，可以通过类似以下方式从 Matlab 连接到 Postgres：

% Add jar file to classpath (ensure it is present in your current dir)
javaclasspath('postgresql-9.0-801.jdbc4.jar');

% Username and password you chose when installing postgres
props=java.util.Properties;
props.setProperty('user', '<your_postgres_username>');
props.setProperty('password', '<your_postgres_password>');

% Create the database connection (port 5432 is the default postgres chooses
% on installation)
driver=org.postgresql.Driver;
url = 'jdbc:postgresql://<yourhost>:<yourport>\<yourdb>';
conn=driver.connect(url, props);

% A test query
sql='select * from <table>'; % Gets all records
ps=conn.prepareStatement(sql);
rs=ps.executeQuery();

% Read the results into an array of result structs
count=0;
result=struct;
while rs.next()
    count=count+1;
    result(count).var1=char(rs.getString(2));
    result(count).var2=char(rs.getString(3));
    ...
end

- user574057

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根据我的经验，URL 应该是：url = 'jdbc:postgresql://<yourhost>:<yourport>/<yourdb>'；（在 Matlab 和 PostgreSQL 服务器运行在同一台 Windows 7 计算机上时，“<yourport>”和“<yourdb>”之间的反斜杠应该改为正斜杠）。 - user842739

我在Linux上也一样。反斜杠不起作用，正斜杠可以。 - luator

建议在读取完值后关闭ResultSet。只需添加rs.close();即可实现。 - Mouse On Mars

Answer 2

作为一种通用的解决方案，您可以直接使用JDBC。现代Matlab都嵌入了JVM。在Matlab中将Postgresql JDBC驱动程序JAR文件放置在Java CLASSPATH上，即可构建JDBC连接和语句对象。请参见“help javaclasspath”。

还有一些需要注意的地方。在Matlab的动态类路径上自动注册JAR中的JDBC驱动程序类似乎有点古怪，可能是因为它使用单独的URL类加载器，而核心JDBC类在系统类加载器中。因此，您可能需要显式地构造JDBC驱动程序类的实例并将它们传递给JDBC方法，而不是使用所有JDBC教程中看到的隐式驱动程序构造。此外，每次从Matlab代码中进行的Java方法调用都会有性能开销，如果您正在循环遍历Matlab代码中的结果集光标，则可能变得非常昂贵。值得编写一个薄包装层，在Java中将JDBC的迭代接口包装成块式的Matlab风格接口，读取结果集并在Java中将其缓冲在数组中，并将整个数组传递回Matlab。

您也可以使用ODBC，但这需要编写链接到ODBC的MEX文件或使用ADO。更难以处理且不太便携。

编辑：如果您通过使用自定义classpath.txt将JAR放置在静态Java类路径上，则可以正确地获取自动驱动程序注册的内容。

- Andrew Janke

Answer 3

我在使用Matlab连接带SSL模式的pgsql数据库时遇到了问题。使用数据库工具箱应该像这样： conn = database('dbname','username','password','org.postgresql.Driver','jdbc:postgresql:databaseURL:dbname:ssl=true&sslfactory=org.postgresql.ssl.NonValidatingFactory&') 但是我却遇到了错误： 'FATAL: password authentication failed for user "username"' 所以我使用了您的脚本，但得到了相同的错误。 我不得不添加以下行：

props.setProperty('ssl','true');

而不是如Matlab帮助中所说的使用SSLFactory...的正常URL。

所以这很好，但我不能使用数据库工具箱的函数...嗯，也不是很重要！

花了我一些时间才发现这一点，所以也许对于其他人有用的是，如果他们也遇到在SSL模式下连接远程数据库的问题。

谢谢！

- Pieter V.

Answer 4

你觉得MYSQL (其他链接)对你有帮助，至少可以作为一个起点吗？

- Jonas

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不幸的是，这在postgresql上不起作用。但可能有一个更通用的解决方案通过ODBC/JDBC？ - Philipp der Rautenberg

Answer 5

（免责声明：需要数据库工具箱）
这是一个完整的示例，展示了如何从Matlab脚本中准备好设置PostgreSQL服务器，请根据需要调整数据库参数：

%Set preferences with setdbprefs.
setdbprefs('DataReturnFormat', 'cellarray');
setdbprefs('NullNumberRead', 'NaN');
setdbprefs('NullStringRead', 'null');


%Make connection to database.
%Using JDBC driver.
conn = database('mydb', 'USERNAME', 'YOURPASSWORD', 'Vendor',... 
  'POSTGRESQL', 'Server', 'SERVERIP', 'PortNumber', 5432);

%Read data from database, just an example on weather table in mydb database
curs = exec(conn, ['SELECT  weather.city'...
    ' , weather.temperature'...
    ' FROM  "mydb"."public".weather ']);

curs = fetch(curs);
close(curs);

%Assign data to output variable
untitled = curs.Data;

%Close database connection.
close(conn);

%Clear variables
clear curs conn

你的用户需要具备登录权限角色，并能够访问表格（ GRANT）。

- droid192

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因为问题明确指出“不使用matlab数据库工具箱”，所以被投下反对票。 - Saaru Lindestøkke

不公平，我在开头明确说明了，并为了完整性而添加。可能还有人在寻找它。 - droid192

很抱歉你觉得这不公平，但如果我的问题是“如何在不使用B的情况下做A”，而你的答案是“使用B”，而明显还有其他方法，我认为你的答案没有用，因此会被踩。 关于“人们可能正在寻找它”：当然。但是当他们在寻找没有工具箱的方法时就不是了。 如果你渴望分享你的知识（这很棒！），你可以自己提问（例如，如何从MATLAB连接到PostgreSQL），并提供自己的答案。 - Saaru Lindestøkke