如何将NHAMCS数据导入R？

Question

我正在与一个同事合作处理CDC的NHAMCS 2011-2014数据，但是他使用的是SAS，而我只有R（因为它是免费的）。数据应该在这里提供：https://www.cdc.gov/nchs/ahcd/ahcd_questionnaires.htm。然而，根据文档，它是针对SAS、SPSS或STATA格式化的。这些文件以前所未见的方式被拆分。我之前曾经能够将文件下载到R中，但是当我在这里下载zip文件并尝试在R中打开它们时，我得到了一串无意义的字符和没有列标题。过去，我成功地使用了下面的代码来获取NHANES数据：

tf <- tempfile()
download.file("https://wwwn.cdc.gov/Nchs/Nhanes/2013-2014/DEMO_H.XPT", tf, mode="wb")                                          
DEMO <- read.xport(tf)

有没有一种方法可以重新处理NHAMCS 2011-2014的内容？

- iPlexpen

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那么你遇到了什么错误？ - r2evans

数据文件与读取它们的程序分别发布。这些数据文件是固定格式的文本文件，已经压缩以节省空间。从SAS或其他程序中应该很容易看出每个字段使用了多少个字符。 - Tom

R和Rstudio是独立的应用程序。您不需要R studio来运行R。 - lmo

Answer 1

SAS（xpt或sas7bdat）格式的数据文件本身不可用。但是，您可以下载Stata数据集。例如，这里的数据集可以正常使用：

download.file(url = "ftp://ftp.cdc.gov/pub/Health_Statistics/NCHS/dataset_documentation/nhamcs/stata/ed2014-stata.zip",
              destfile = "ed2014-stata.zip")
unzip("ed2014-stata.zip")

library(haven)
nhamcs2014 <- read_dta("ed2014-stata.dta")

- Dominic Comtois

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沿着这个评论的思路，R语言的rio是一个非常好的包，可以处理各种数据格式。我用社区卫生中心的NAMCS 2014数据集进行了测试。我下载了STATA数据集，但在加载rio库后使用import("namcs2014_chc-stata.dta")成功地将其导入到R中。 - Kevin Hu

Answer 2

这些文件以自解压缩格式（可能特定于Windows）或ZIP格式分发。当我扩展2015年的zip文件时，它从起始大小的2.3 MB变成了55MB。该文件采用固定字段格式，R具有read.fwf函数来处理该格式。此外，大多数美国公共使用数据集都有由@AnthonyDamico记录的访问方法，尽管这似乎是他错过的一个。SAS输入语句位于：ftp://ftp.cdc.gov/pub/Health_Statistics/NCHS/Dataset_Documentation/NHAMCS/sas/。尽管如此，一旦您收集了三年的数据及其相关的SAS输入程序，他的SAScii软件包无疑会非常有用。

- IRTFM