将二进制文件读入R

Question

将二进制文件读入R

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我想将一个二进制文件读入R，但是这个文件的数据行是以二进制代码写入的。因此，它没有一个完整的数据集属于一个列，而是存储为数据行。以下是我的数据样式：

Bytes 1-4:            int        ID
Byte 5:               char       response character
Bytes 6-9:            int        Resp Dollars
Byte 10:              char       Type char

有人能帮我解决如何将这个文件读入R的问题吗？

以下是我到目前为止尝试过的代码。我尝试了几种方法，但效果有限。不幸的是，我不能在公共网站上发布任何数据，抱歉。我相对来说是R的新手，所以需要一些帮助来改进代码。

> binfile = file("File Location", "rb")
> IDvals = readBin(binfile, integer(), size=4, endian = "little")
> Responsevals = readBin(binfile, character (), size = 5)
> ResponseDollarsvals = readBin (binfile, integer (), size = 9, endian= "little")
Error in readBin(binfile, integer(), size = 9, endian = "little") : 
  size 9 is unknown on this machine
> Typevals = readBin (binfile, character (), size=4)
> binfile1= cbind(IDvals, Responsevals, ResponseDollarsvals, Typevals)
> dimnames(binfile1)[[2]]
[1] "IDvals"            "Responsevals"        "ResponseDollarsvals" "Typevals"  

> colnames(binfile1)=binfile
Error in `colnames<-`(`*tmp*`, value = 4L) : 
  length of 'dimnames' [2] not equal to array extent

- user1819654

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你能发布数据文件的前几行吗？ - user399470

使用readBin函数读取原始字节，将其推入行数与文件相同的矩阵中，然后从列集合中读取readBin。这很快。对于更复杂的格式，可以通过删除所有标题内容并快速读取来实现：https://dev59.com/HmnWa4cB1Zd3GeqP3LS8 - mdsumner

提供文件，我会组合一个示例。 - mdsumner

mdsumner - 我无法分享数据文件，因为公司有保密协议 - 你能否发布简化版本的代码？我对R相对较新，所以在跟随您发布的链接中遇到了一些困难....谢谢！ - user1819654

我不想做的事情是生成测试文件，这也是你问题的问题所在。 - mdsumner

1个回答

网页内容由stack overflow 提供, 点击上面的

可以查看英文原文，
原文链接

- Matthew Lundberg · Accepted Answer

你可以将文件打开为原始文件，然后使用readBin或readChar命令获取每一行。在进行操作时，将每个值添加到列中。

my.file <- file('path', 'rb')

id <- integer(0)
response <- character(0)
...

循环执行此代码块：

id = c(id, readBin(my.file, integer(), size = 4, endian = 'little'))
response = c(response, readChar(my.file, 1))
...
readChar(my.file, size = 1) # For UNIX newlines.  Use size = 2 for Windows newlines.

然后创建你的数据框架。

参见这里：http://www.ats.ucla.edu/stat/r/faq/read_binary.htm