这是我在我的代码中遇到的一个相当棘手的挑战。首先，我所提供的代码无法运行，因为我使用了一个Excel表格（但如果有人想尝试使用我的代码，我很乐意通过电子邮件发送它）。
我手头有一份Excel表格，其中记录了我拍摄的显微图像中横截面纤维的数据。这些信息基本上包括：部位的“位置”、“面积”和“旋转角度”。
从这些信息中，我计算出定向角Phi和Gamma的角度，然后使用散点函数为每个Phi角度值绘制不同颜色的点。我对于10度范围内使用一个常数颜色。 这使得我的图片看起来像这样：
现在我的目标是计算每个同质区域的面积。因此，我寻求一种方法来绘制所有在-10 +10范围内的点（我现在正在做20度，但之后将做10度）。我使用了一个循环，然后获得了如下图所示的图片：
白色表示点在我选择的范围内。 然后我使用MATLAB中的工具箱将每个点转换为像素。所以我会得到一个黑色背景，有很多白色像素，然后我使用imdilate来制作圆形，填充孔并隔离每个具有特定颜色的区域。 最后，我使用边界和补丁函数来创建每个边界并将其填充为一种颜色。我得到了这样的图片：
这就是我想要的，我可以获得每个区域的面积和总面积（我使用了一个阈值来丢弃小区域）。然后我对每个区域运行代码几次，并使用imfuse将它们放在一起，看看它们的样子。
问题在于，它们重叠得很多，那是因为我的数据中存在一些错误，因此一些蓝点会在红点上等等。 因此，我想运行代码一次，然后当我用另一个范围重新运行它时，它做同样的事情，但不考虑已经绘制的内容。
我尝试通过首次运行后保存矩阵bw4，并在绘制黑白图像时添加条件来实现这一点，即如果Phi在我的范围内并且没有白色，则可以放置白色，否则就是黑色。 但似乎不起作用。
我知道这很难解释，但我会感激任何想法，并通过电子邮件或其他方式进行交流。 我现在提供完整的代码，如果您想在您的计算机上运行它并自己看看，我可以发送给您我的Excel表格。
我手头有一份Excel表格，其中记录了我拍摄的显微图像中横截面纤维的数据。这些信息基本上包括：部位的“位置”、“面积”和“旋转角度”。
从这些信息中，我计算出定向角Phi和Gamma的角度，然后使用散点函数为每个Phi角度值绘制不同颜色的点。我对于10度范围内使用一个常数颜色。 这使得我的图片看起来像这样：
现在我的目标是计算每个同质区域的面积。因此，我寻求一种方法来绘制所有在-10 +10范围内的点（我现在正在做20度，但之后将做10度）。我使用了一个循环，然后获得了如下图所示的图片：
白色表示点在我选择的范围内。 然后我使用MATLAB中的工具箱将每个点转换为像素。所以我会得到一个黑色背景，有很多白色像素，然后我使用imdilate来制作圆形，填充孔并隔离每个具有特定颜色的区域。 最后，我使用边界和补丁函数来创建每个边界并将其填充为一种颜色。我得到了这样的图片：
这就是我想要的，我可以获得每个区域的面积和总面积（我使用了一个阈值来丢弃小区域）。然后我对每个区域运行代码几次，并使用imfuse将它们放在一起，看看它们的样子。
问题在于，它们重叠得很多，那是因为我的数据中存在一些错误，因此一些蓝点会在红点上等等。 因此，我想运行代码一次，然后当我用另一个范围重新运行它时，它做同样的事情，但不考虑已经绘制的内容。
我尝试通过首次运行后保存矩阵bw4，并在绘制黑白图像时添加条件来实现这一点，即如果Phi在我的范围内并且没有白色，则可以放置白色，否则就是黑色。 但似乎不起作用。
我知道这很难解释，但我会感激任何想法，并通过电子邮件或其他方式进行交流。 我现在提供完整的代码，如果您想在您的计算机上运行它并自己看看，我可以发送给您我的Excel表格。
clearvars -except data colheaders bw4
close all
clc
%%
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%%% CHANGE DATA FOR EACH SAMPLE %%%
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
cd 'C:\Users\dkarta\Desktop\Sample 12\12.6'
data=xlsread('Sample12_6res.xlsx');
cd 'C:\Users\dkarta\Documents\MATLAB'
%data=Sample121res; % Data name
imax=length(data); % Numbers of rows in data sheet
y=11900; % Number of pixels in the y on image j
%%
data(:,15)=data(:,9)*pi/180; % Convers Column 9 (angle of rotation) in rads
data(:,16)=y-data(:,6); % Reset the Y coordinate axis to bottom left
delta = 0 : 0.01 : 2*pi; % Angle in paramteric equations
theta=45*pi/180; % Sample cutting angle in rads
%AA=[data(:,5)' data(:,16)' phi']
% Define colors
beta=acos(data(1:imax,8)./data(1:imax,7));%./acos(0);
phi=atan(sin(beta).*cos(data(1:imax,15))./(sin(theta)*sin(beta).*sin(data(1:imax,15))+cos(theta)*cos(beta)))/(pi/2);
phi2=phi/2+1/2; % Scales in plane angle phi between 0 and 1
gamma=atan((cos(theta)*sin(beta).*sin(data(1:imax,15))-sin(theta)*cos(beta))./...
(sin(theta)*sin(beta).*sin(data(1:imax,15))+cos(theta)*cos(beta)))/(pi/2);
gamma2=gamma+1/2; % Scales out of plane angle gamma between 0 and 1
%%
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%%% MESHGRID AND COLOURMAP %%%
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
x1=data(1:imax,5);
y1=data(1:imax,16);
z1=phi*90;
z2=gamma*90;
n=300;
%Create regular grid across data space
[X,Y] = meshgrid(linspace(min(x1),max(x1),n), linspace(min(y1),max(y1),n));
% Creating a colormap with 10 degree constant colors
map4=[0 0 1;0 1/3 1;0 2/3 1; 0 1 1;0 1 2/3;0 1 1/3;0 1 0;1/3 1 0;2/3 1 0;1 1 0;1 0.75 0;1 0.5 0;1 0.25 0;1 0 0;0.75 0 0.25;0.5 0 0.5;0.25 0 0.75; 0 0 1];
Colormap4=colormap(map4);
h=colorbar;
caxis([-90 90])
set(h, 'YTick', [-90:10:90])
%%
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%%% PLOT USING SCATTER - ISOLATE SOME REGIONS %%%
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
a=-10; % Lower boundary for angle interval
b=10; % Upper boundary for angle interval
c=z1>a & z1 < b;
c=c.*1;
%j=1;
y1=(y1-min(y1)+1);
y2=max(y1)-y1+1;
[X1,Y1]=meshgrid(1:500,1:500);
griddata(x1,y2,c,X1,Y1);
clear c1
for i=1:imax
if z1(i)< b && z1(i)> a %&& bw4(round(y1(i)),round(x1(i))) == 0
c(i) = 1;
c1(round(y2(i)),round(x1(i)))=1;
else
c(i)= 0;
c1(round(y2(i)),round(x1(i)))=0;
end
end
C=[c c c];
%c(find(c==0)) = NaN;
%contourf(X,Y,griddata(x1,y1,c,X,Y),100,'EdgeColor', 'None')
figure(1), scatter(x1,y1,3,z1,'filled');
axis equal
axis ([0 8000 0 12000])
axis off
figure(2), scatter(x1,y1,3,C,'filled');
axis equal
axis ([0 8000 0 12000])
axis off
se=strel('disk',50,8);
bw2=imdilate(c1,se);
bw4=bwlabel(bw2);
bw3=imfill(bw4,'holes');
max(bw4(:));
figure(3),imshow(c1,'InitialMagnification', 10);
figure(4), imshow(bw2,'InitialMagnification', 10);
figure(5), imshow(bw3,'InitialMagnification', 10);
figure(6),imshow(label2rgb(bw4),'InitialMagnification', 10);
k=ones(max(bw4(:)),1);
clear bw5
for i=1:length(x1)
if bw3(round(y2(i)),round(x1(i))) ~= 0
m=bw3(round(y2(i)),round(x1(i)));
bw5{m}(k(m),1)=x1(i); bw5{m}(k(m),2)=y2(i);
k(m)=k(m)+1;
end
end
figure(7), imshow(~c1,'InitialMagnification', 10);
hold on
for i=1:max(bw4(:))
%scatter(bw5{i}(:,1),bw5{i}(:,2))
j = boundary(bw5{i}(:,1),bw5{i}(:,2),0.5);
%poly=convhull(bw5{i}(:,1),bw5{i}(:,2));
%plot(bw5{i}(poly,1),bw5{i}(poly,2)), title('convhull')
if polyarea(bw5{i}(j,1),bw5{i}(j,2))> 10^5;
patch(bw5{i}(j,1),bw5{i}(j,2),'r'), title('boundary')
indexminy(i)=find(min(bw5{i}(:,2)) == bw5{i}(:,2));
indexminx(i)=find(min(bw5{i}(:,1)) == bw5{i}(:,1));
indexmaxy(i)=find(max(bw5{i}(:,2)) == bw5{i}(:,2));
indexmaxx(i)=find(max(bw5{i}(:,1)) == bw5{i}(:,1));
%xmin = bw5{i}(indexminx); xmax = bw5{i}(indexmaxx);
%ymin = bw5{i}(indexminy); ymax = bw5{i}(indexmaxy);
str=[(indexminx(i)+indexmaxx(i))/2,(indexminy(i)+indexmaxy(i))/2,'Region no.',num2str(i)];
text((min(x1(i))+max(x1(i)))/2,(min(y1(i))+max(y1(i)))/2,str)
polya(i)=polyarea(bw5{i}(j,1),bw5{i}(j,2));
end
end
spolya=sum(polya(:))
print -dpng -r500 B
这里有更多图片，展示了我将它们融合在一起的情况：
当我进行融合时：
你可以看到它们重叠在一起，这不是我想要的，所以我想让我创建的每个图像“知道”我在之前的运行中正在做什么，以便它们不会重叠。 我想获取每个区域的百分比面积，如果它们重叠，则无法使用我的样本的实际总面积，结果会出错。