我无法在El Capitan Beta 5上安装和运行fakes3 gem。
我尝试了以下方法：
sudo gem install fakes3
ERROR: While executing gem ... (Errno::EPERM)
Operation not permitted - /usr/bin/fakes3
然后我尝试按照CocoaPods的方式进行操作。虽然对于CocoaPods来说是有效的，但对于Fakes3则不行。
mkdir -p $HOME/Software/ruby
export GEM_HOME=$HOME/Software/ruby
gem install cocoapods
[...]
1 gem installed
gem install fakes3
ERROR: While executing gem ... (Gem::FilePermissionError)
You don't have write permissions for the /Library/Ruby/Gems/2.0.0 directory.
免责声明: @theTinMan 和其他 Ruby 开发者经常指出在安装 gems 时不要使用 sudo，并指向诸如RVM之类的东西。当进行 Ruby 开发时，这是绝对正确的。请继续使用那些。
然而，我们中的许多人只想要一些二进制文件，这些二进制文件恰好作为 gem 分发（例如fakes3，cocoapods，xcpretty...）。我绝对不想费心去管理一个单独的 ruby。以下是您更快的选择：
如果您希望这些工具被全局安装，则使用 sudo 可能是可以的。
问题是这些二进制文件被安装到 /usr/bin 中，自 El Capitan 以来就受限了。但是，您可以将它们安装到 /usr/local/bin 中。那是Homebrew安装其内容的地方，因此它可能已经存在。
sudo gem install fakes3 -n/usr/local/bin
宝石将被安装到/usr/local/bin，如果在用户的路径中，则系统上的每个用户都可以使用它们。
以下内容将在~/.gem中安装宝石，并将二进制文件放在~/bin中（然后您应将其添加到PATH中）。
gem install fakes3 --user-install -n~/bin
无论哪种方式，您都可以将这些参数添加到您的~/.gemrc文件中，这样就不必记住它们：
gem: -n/usr/local/bin
即 echo "gem: -n/usr/local/bin" >> ~/.gemrc
或者
gem: --user-install -n~/bin
即 echo "gem: --user-install -n~/bin" >> ~/.gemrc
(提示: 您还可以添加--no-document来跳过生成Ruby开发者文档。)
gem install时指定所需路径解决了这个问题。 - Daniel Saidi.gemrc 文件应该有 gem: -n /usr/local/bin （-n 后面需要加一个空格）。 - Paul Schreiberbrew install ruby
之后，您需要注销并重新登录，可以通过图形方式或仅重新启动终端实现。
which -a ruby在我的机器上，它会返回以下结果：$ which -a ruby
/usr/local/bin/ruby
/usr/local/bin/ruby
/usr/bin/ruby至于为什么 /usr/local/bin 会出现两次，看起来是因为 brew install ruby 命令会将其添加到 PATH 中，即使它已经存在。可以推测，/usr/local 中的 Ruby 配置了一个不需要 root 访问权限的 gem 安装位置（这实际上非常合理）。 - WallStProggem install 将仍然失败。 - WallStProgrehash 命令，确保你的 shell 知道 $PATH 中有一个新的 ruby。即使在你还没有在 shell 会话中运行 ruby 的情况下，这也是不必要的。 - Radon Rosborough这是因为OS X“El Capitan”的新安全功能所致。
尝试添加--user-install而不是使用sudo：
$ gem install *** --user-install
$ gem install fake3 --user-install
sudo gem install -n /usr/local/bin cocoapods
试试这个。它肯定会起作用。
您需要更新Xcode到最新版本（v7.0.1），一切都会正常工作。
如果安装了最新版的Xcode后仍然无法正常运行，请尝试以以下方式安装gem：
sudo gem install -n /usr/local/bin GEM_NAME_HERE
sudo gem install -n /usr/local/bin fakes3
sudo gem install -n /usr/local/bin compass
sudo gem install -n /usr/local/bin susy
升级到OS X El Capitain后，/usr/local目录会以多种方式进行修改：
[编辑] 还有一件预备工作要做：升级Xcode...
$ sudo chown -R $(whoami):admin /usr/local
这将修复/usr/local目录的权限，从而有助于使gem install和brew install|link|...命令正常工作。
确保您已经修复了/usr/local目录的权限(参见上面的 #1)
首先尝试使用以下命令重新安装您的gem：
sudo gem install <gemname>
请注意，它将安装指定 gem 的最新版本。
如果您不想面临向后兼容问题，建议您首先确定要获取哪个 gem 的哪个版本，然后使用 -v version 重新安装它。请看下面的示例，以确保系统不会获取 capistrano 的新版本。
$ gem list | grep capistrano
capistrano (3.4.0, 3.2.1, 2.14.2)
$ sudo gem install capistrano -v 3.4.0
更新Brew并升级您的配方
$ brew update
$ brew upgrade
你可能还需要手动重新链接其中的一些。
$ brew link <formula>
正如所说，这个问题源于Mac OSX从“El Capitan”开始的安全功能。
使用系统默认的Ruby，安装过程发生在/Library/Ruby/Gems/2.0.0目录中，该目录对用户不可用并会导致错误。
您可以使用以下命令查看Ruby环境参数：
$ gem env
有一个安装目录和一个用户安装目录。为了使用用户安装目录而不是默认的安装目录，您可以使用--user-install参数，而不是使用sudo，这从来都不是一种推荐的做法。
$ gem install myGemName --user-install
~/.gem/Ruby/2.0.0/bin。但是为了让安装的宝石（gems）可用，这个目录应该在你的路径中可用。根据Ruby FAQ，你可以将以下行添加到~/.bash_profile或~/.bashrc中。if which ruby >/dev/null && which gem >/dev/null; then
PATH="$(ruby -rubygems -e 'puts Gem.user_dir')/bin:$PATH"
fi
然后关闭并重新加载终端或重新加载您的.bash_profile或.bashrc（. ~/.bash_profile）
sudo gem pristine ffi --version 1.9.3
继续处理需要修复的宝石列表。 总共需要大约10分钟来修复它，但您将可以使用compass的终端命令。
sudo gem install -n /usr/local/bin <gem_name> -- --use-system-libraries --with-xml2-include=/usr/include/libxml2 --with-xml2-lib=/usr/lib/
具体来说，在安装nokogiri gem v1.6.8时，我在OS X El Capitan上遇到了问题。
最终，以下方法对我有效：
sudo gem install -n /usr/local/bin nokogiri -- --use-system-libraries --with-xml2-include=/usr/include/libxml2 --with-xml2-lib=/usr/lib/
brew install libxml2 libxslt
brew install libiconv
然后检查确保您已安装Xcode命令行工具：
xcode-select --install
xcode-select: error: command line tools are already installed, use "Software Update" to install updates
rvm implode
\curl -sSL https://get.rvm.io | bash -s stable --ruby
rvm reload
sudo安装Ruby或更改gems。相反，使用rbenv或RVM来安装和管理Ruby。阅读并遵循它们各自网站上的说明。在任何情况下，在安装后，除非您知道正在更改什么以及为什么要这样做，否则不要使用sudo。 - the Tin Man