在R中将文件夹中的多个csv文件读入单个数据框架中

Question

我有一个包含332个csv文件的文件夹。这些文件名分别为001.csv，002.csv，003.csv，............，330.csv，331.csv，332.csv。所有文件具有相同数量的变量和相同的格式。

我需要将所有文件读入一个数据框中。我一直在逐个读取并使用rbind，但这太繁琐了。

需要帮助。

- Madhumita

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尽管复制可以让你了解该怎么做，但这个确切的问题之前已经在其他问题中发布过，比如这个。 - Jaap

我也有332个csv文件在我的Coursera作业中 ;) - user1535147

Answer 1

尝试使用lapply和do.call

file_names <- dir() #where you have your files

your_data_frame <- do.call(rbind,lapply(file_names,read.csv))

- Mario Fajardo

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这很有帮助。只是要提醒一下：如果只读取文件夹名称，请在dire()中包括“full.names = TRUE”。 - LCheng

Answer 2

使用data.table的解决方案，答案摘自我之前在 Stack Overflow 上使用过的帖子。

library(data.table)  
files <- list.files(path = "/etc/dump",pattern = ".csv")
temp <- lapply(files, fread, sep=",")
data <- rbindlist( temp )

- on_the_shores_of_linux_sea

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如何在数据框中捕获文件名，并将其作为单独的列来标识数据来源？ - RanonKahn

@Arun 我认为你需要在你的回答中.csv前面加上2个反斜杠。 - Martin

Answer 3

这里有一个可能的解决方案。也可以使用apply函数来实现。

path <- "path_to_files"
files <- c(paste("00",2:9,".csv",sep=""),
           paste("0",10:99,".csv",sep=""), 
           paste(100:332,".csv",sep="")
           )
#Read first file to create variables in a data frame
data <- read.csv(paste(path,"001.csv",sep="/"))

#Read remaining files and rbind them to dataset
for (f in files) {
   data <- rbind(data,read.csv(paste(path, files, sep="/")))
}

- MBDK

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感谢大家的即时帮助。以下带有header=TRUE的命令对我很有用。file_names <- dir() #你的文件所在位置your_data_frame <- do.call(rbind,lapply(file_names,read.csv, header=TRUE)) - Madhumita