logo标签列表

在R中安装软件包

rinstallationpackagecran
18

由于某种原因，我突然无法在R中安装包（我随后更新到了最新版本的R，并且正在运行Windows 7）。例如，如果我输入：

install.packages('beeswarm')
安装包到 'D:/Rlibs'（因未指定 'lib'）--- 请为此会话选择一个CRAN镜像 --- 尝试 URL 'http://www.stats.bris.ac.uk/R/bin/windows/contrib/3.0/beeswarm_0.1.5.zip'，内容类型“text/html”的长度未知，打开URL下载了1859字节。
读取文件夹中的“DESCRIPTION”文件时出错，错误信息为“cannot open the connection”，另外还有警告消息：“在解压缩zip文件时出现错误。可能无法打开压缩文件'beeswarm/DESCRIPTION'，出现这种情况的可能原因是'文件或目录不存在'”。
我已经阅读过在Windows 7中有可能对某些文件夹写入权限存在重要限制，因此我费了一些力气将R和库文件夹安装在计算机的非默认区域，并允许自己访问某些文件夹，但结果仍然不行。当我输入以下命令时，也可能很重要：
.libPaths()

# [1] "D:/Rlibs"                                             
# [2] "C:/Users/L.Halsey/Documents/R/win-library/3.0"        
# [3] "C:/Users/L.Halsey/Documents/Documents/R-3.0.1/library"

我试图创建多个文件夹，以创建一个可以成功安装库并使用“环境变量”从开始按钮设置它们被R识别的文件夹。然而，我不知道如何删除它们 - 不确定这是否与我现在无法安装/更新软件包的总体问题相关。

5个回答
10

报告的错误是无法打开连接。在Windows中，这通常是防火墙问题，可以在Windows R FAQ中找到相关解决方案（传送门）。通常的第一次尝试应该是运行internet2.dll。如果您使用控制台会话，则可以使用以下命令：

setInternet2(TRUE)

你想得没错，这不是由于你的库设置引起的。错误信息没有提到权限。

我认为仅键入.libPaths不应该返回那个字符向量，因为在我的机器上，我需要键入.libPaths()才能看到类似的结果。如果您想减少库的位置数量，可以使用.libPaths函数来设置值。 这将选择现有路径的第二个和第三个路径。

 .libPaths( .libPaths()[2:3] )

内部调用检索路径向量，外部调用将其设置为缩小向量。

7

以管理员身份运行RStudio解决了我的问题！

3
我可能会重复一些其他stackoverflow答案的内容，但是我遇到了与OP完全相同的错误，即： 警告信息：1：在解压缩zip文件时出现错误，错误代码为1。2：在读取.dcf文件时出现错误，无法打开压缩文件“zoo/DESCRIPTION”，可能原因是“没有这个文件或目录” 事实证明，虽然我作为用户有权限在某个目录中写入，但R没有。为了确保您没有类似的问题，请执行以下操作：
  1. get a usb drive, let's name it E
  2. download package source as a .zip file and store it onto usb-drive in some directory, let's name it E:/source
  3. Create directory for libraries on the usb drive, let's name it E:/libs

  4. Install packages calling R command install.package from the R console and setting all relevant directories to point to your usb drive:

    (here I use package zoo as an example) 

    install.packages("E:/source/zoo_1.7-12.zip", 
                 destdir = 'E:/source',  # no "/" after the path
                 lib = 'E:/libs', 
                 repos = NULL)

  5. Load the package from the directory, where you installed it: library('zoo', lib.loc = 'E:/libs')

在确认您的USB驱动器上已经成功运行后，您可以开始解决目录权限问题，并尝试通过更改上述代码中的路径来进行测试。

更新： ��某些Windows环境下，甚至您的USB闪存可能会受到R的读写保护。请确保使用您正在工作的计算机检查权限。

2
以下内容对我有用（基于上面的答案）。
install.packages("clustvarsel", lib = "C:/Users/dnentchev/My Programs/R-3.2.2/library")
-2

我曾经遇到过同样的问题。我关闭了Windows防火墙，并以管理员身份运行RStudio。这样，错误就被解决了。

网页内容由stack overflow 提供, 点击上面的
可以查看英文原文，
原文链接