在R包中使用数据集

Question

我正在尝试在CRAN上获取我的软件包(https://github.com/jmcurran/relSim)的最新版本。由于在一个未公开的函数中使用了包含在软件包中的数据集(即用户必须使用:::运算符才能使用它)，因此该软件包被拒绝了。以下是代码片段:

testIS = function(nc = c(3, 2), locus = 1, seed = 123456){
  set.seed(seed)
  np = 2 * nc[2]
  freqs = USCaucs$freqs

数据集已包含在软件包中，根据 Hadley 的建议，我在 DESCRIPTION 文件中加入了 LazyData: true。然而，我从 https://win-builder.r-project.org 收到了一条提示信息，但我不知道如何解决。

 * checking R code for possible problems ... [11s] NOTE
 testIS: no visible binding for global variable 'USCaucs'
 Undefined global functions or variables::
   USCaucs

我觉得这很令人沮丧，因为正如我所说，这个功能甚至没有被导出（它也可以在不报错的情况下工作，因为该包已加载此数据集）。非常感谢您的帮助。

- James Curran

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包裹因备注被拒绝了吗？你有得到任何进一步的细节吗？对于内部数据，建议使用R/sysdata.rda。 - alan ocallaghan

是的@aocall - 现在有一个CRAN预检系统，似乎是基于winbuilder。你促使我将解决方案发布为我的问题的答案，就像你所建议的那样。 - James Curran

Answer 1

解决方案似乎需要一些重复。根据Thomas Lumley的建议，我将对象放置在R/sysdata.rda中，并且也放在 data/USCaucs.rda 中。我遵循了Hadley Wickham的建议，使用参数internal设置为TRUE的devtools :: use_data，以便以正确的方式保存为软件包。

如上所述，此解决方案涉及复制数据。对于像这里一样小的对象，这不是问题，但我认为还有更加优雅的解决方案。

- James Curran

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你可以将一个文件硬链接到另一个文件，并在data-raw/USCaucs.rda中编写脚本来完成这一步骤。 - alan ocallaghan

我有同样的情况，数据被用在函数内部，但对于用户来说也是一个有用的参考。我想我会像你一样复制它。 - see24

我和你@see24有着完全相同的情况，但是我无法忍受将相同的数据集同时用作内部和导出的不雅之处（不确定为什么！）。对我有效的解决方案是在需要引用导出数据时使用包命名空间（以使其作为内部处理？）- 参见此答案https://dev59.com/-6zla4cB1Zd3GeqPF_8f#51410084。这感觉很奇怪，因为在一个包中，通常不需要给自己的函数加上命名空间引用 - 但是对于数据（如果不是内部的话）则需要 - 我想是这样。另一种方法是调用data(mydataset)。 - Francis Barton