R SSH隧道MySQL

Question

R SSH隧道MySQL

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我正在寻找一种方法，可以使用SSH隧道连接到MySQL服务器（而不是文件），并在R中执行操作；我认为这需要结合RCurl和RODBC来完成，但我似乎无法使其正常工作。

我看到了这篇文章和这篇文章，它们讨论了如何利用SSH连接到特定的文件或表，但我希望将其作为Shiny应用程序的一部分使用，该应用程序将根据用户输入执行不同的SQL查询，这将需要连接到服务器而不是特定的文件。

我猜测代码应该类似于这样：x = scp("remote.ssh.host.com", "/home/dir/file.txt", "My.SCP.Passphrase", user="username")，但是我应该将"/home/dir/file.txt"替换为odbcConnect()语句还是替换为我想要访问的特定数据库的端口号呢？

编辑：我用于常规odbcConnect()的代码行是odbcConnect(dsn, uid = "userid", pwd = "password")。问题的一部分是，我正在Windows上开发它，但它将部署到由其他人处理的Linux服务器上，因此我正在努力弄清楚在我的server.R代码中需要使用什么来连接到数据库。

- Corey Christensen

哦，R运行在什么操作系统上？如果您正在Windows上运行，您可以首先使用PuTTy设置隧道，然后连接到隧道。如果您在Mac OS或Linux上，则可以通过SSH命令设置隧道，并从R中调用该命令。 - nograpes

另外，当您不需要隧道时，您通常使用哪条线连接到MySQL服务器？ - nograpes

@nograpes，我刚刚添加了一个编辑来解决你的两个意见。 - Corey Christensen

1个回答

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可以查看英文原文，
原文链接

- nograpes · Accepted Answer

好的，要在Windows上测试这个功能，你可以选择安装Cygwin或者安装OpenSSH，这样你就可以像在Linux中一样，在Windows命令行中运行ssh。

一旦你在Windows上成功运行了ssh，那么首先尝试通过SSH建立一个隧道。在命令行中输入以下命令：

ssh -f <server_user>@<server_ip>  -L <unused_local_port>:localhost:<database_remote_port> -N

显然，将“<>”中的所有内容替换为适当的信息。它会要求输入密码，请记住这不是数据库密码，而是服务器本身的密码。值得注意的是，server_ip不必是具有数据库的服务器，只要在正确的子网内运行SSH服务器的任何服务器即可，这几乎是所有Linux机器。

现在，设置一个ODBC连接，除了将IP设置为localhost，端口设置为unused_local_port。现在，在R中尝试连接到新的ODBC连接。如果这样做可以成功，那么你已经完成了一半。

下一个问题是密码，因为你将需要输入密码来通过SSH进行连接，但在R中，你无法在简单的system命令之后输入密码。所以你需要设置一些公共/私人RSA密钥对。值得注意的是，这将使得任何具有Windows用户/密码访问权限的人现在都可以自动访问你的服务器，所以要小心。首先，生成一个SSH密钥：

ssh-keygen -t rsa

不要使用简单密码，并将其保存在默认位置。现在，在远程主机上创建公钥目录，并将您的公钥放在其中。

# This creates a directory on the other machine if it wasn't already there. (Type in your password on the remote machine)
ssh <server_user>@<server_ip> mkdir -p .ssh
# This adds your public key to the list of accepted ones:
cat ~/.ssh/id_rsa.pub | ssh <server_user>@<server_ip> 'cat >> .ssh/authorized_keys'

现在请尝试从命令行再次创建您的隧道：

 ssh -f <server_user>@<server_ip>  -L <unused_local_port>:localhost:<database_remote_port> -N

如果它没有要求输入密码，那么您已经成功创建了密钥对。现在，您可以从命令行运行ssh命令。但在此之前，请尝试终止您的ssh命令，以确保R实际上正在创建隧道，而不是重用旧的隧道。您可以通过Windows任务管理器（Ctrl + Alt + Esc）执行此操作，并右键单击并结束ssh.exe进程。

因此，只需运行：

system('ssh -f <server_user>@<server_ip>  -L <unused_local_port>:localhost:<database_remote_port> -N')

然后连接到您的新隧道化ODBC连接。