如何解决pandoc问题

Question

如何解决pandoc问题

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我在使用VSCode中的saveWidget时遇到了问题，可能是由于pandoc引起的。

当我在Rstudio中运行以下代码时，它可以正常工作，并生成mtcars.html。

htmlwidgets::saveWidget(DT::datatable(mtcars), "mtcars.html", selfcontained = TRUE, title = "mtcars")

然而，当我将相同的代码移植到VSCode时，它会出现错误提示，指出

Error in htmlwidgets::saveWidget(DT::datatable(mtcars), "mtcars.html",  : 
  Saving a widget with selfcontained = TRUE requires pandoc. For details see:
https://github.com/rstudio/rmarkdown/blob/master/PANDOC.md

我怀疑 VSCode 没有识别出 pandoc 的路径，因为我在 VSCode 中输入 find_pandoc 来查找版本和目录，结果显示

> rmarkdown::find_pandoc()
$version
[1] '0'

$dir
NULL

然而，在Rstudio中它显示

> find_pandoc()
$version
[1] ‘2.7.2’

$dir
[1] "C:/Program Files/RStudio/bin/pandoc"

- ThomasIsCoding

我不知道从什么时候开始这样做的，但是我在我的~/.Rprofile中有Sys.setenv(RSTUDIO_PANDOC="/R/RStudio/bin/pandoc")（据说是为了不使用R/RStudio之外安装的pandoc）。如果您在VSCode环境中设置了它，那么find_pandoc()是否能够找到它，并且错误是否消失？ - r2evans

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@r2evans 嗯...看起来错误还在。 - ThomasIsCoding

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@ThomasIsCoding 在 VSCode 中运行 rmarkdown:::find_program("pandoc") 会返回什么？Sys.getenv("RSTUDIO_PANDOC") 呢？Sys.which("pandoc") 呢？以上全部在 VSCode 中。你可能需要将 pandoc 可执行文件的路径（"C:/Program Files/RStudio/bin/pandoc"）添加到系统范围内的 PATH 变量中。 - slava-kohut

问题在于RSUDIO_PANDOC变量没有在VSCode中设置为pandoc路径。如果将pandoc添加到PATH有所帮助，我会写一份详细的答案。 - slava-kohut

@slava-kohut 哇！太感谢了。将PATH变量添加到系统环境变量中就可以解决问题了！请详细写下您的答案，我会接受它！ - ThomasIsCoding

1个回答

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可以查看英文原文，
原文链接

- slava-kohut · Accepted Answer

为了理解发生了什么，让我们来看一下rmarkdown:::find_pandoc()的源代码。在那里我们可以找到以下几行：

sys_pandoc <- find_program("pandoc")
sources <- c(Sys.getenv("RSTUDIO_PANDOC"), if (nzchar(sys_pandoc)) dirname(sys_pandoc))

sources 用于获取 pandoc 路径。我怀疑在你的情况下，RSTUDIO_PANDOC 没有被设置，因此 rmarkdown:::find_pandoc() 依赖于 find_program("pandoc") 来查找路径。如果你进一步查看其源代码，你会发现该路径是通过运行 Sys.which 来确定的，这相当于从 shell 提取路径：

系统命令 which 报告可执行文件（包括可执行脚本）的完整路径名，就像在 shell 中执行一样...

话虽如此，在你的系统中需要将 pandoc 的路径添加到 PATH 环境变量中。