使用rpy.robjects时出现消息“无法确定R主目录：[WinError 2]系统找不到指定的文件”。

Question

使用rpy.robjects时出现消息“无法确定R主目录：[WinError 2]系统找不到指定的文件”。

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我正在使用rpy2 API在Python中实现一个简单的函数。

在VScode中，我成功地打印了置信区间，并调用了使用robjects创建的函数来计算Z统计量，如图所示。但是在打印值之前，我收到了消息“无法确定R home：[WinError 2]系统找不到指定的文件”。在Jupyter中出现相同的消息，但当调用rpy2函数时，它不允许我打印任何东西，会出现错误“Conversion'rpy2py'未定义为类型为'<class'rpy2.rinterface.SexpClosure'>'的对象”。

仅导入软件包本身“import rpy2.robjects”也会检索到相同的消息。导入rpy2本身不会显示任何内容。

我尝试将Rscript.exe和R.exe路径添加到系统变量中，但没有起作用（不确定是否正确），尝试重新安装R，但也没有起作用。

有什么线索可以解决这个问题吗？

在VSCode中使用该函数并输出的图像与之前相同函数在Jupyter中的输出

- João

1个回答

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可以查看英文原文，
原文链接

- kesh · Accepted Answer

错误的原因是Windows R已更改其注册表结构，导致当前rpy2的R安装路径检测过时。我已经推送了一个PR来解决这个问题，但在此期间，您的解决方案是设置R_HOME环境变量。

您可以执行以下操作：

import os
os.environ["R_HOME"] = r"C:\Program Files\R\R-4.2.0" # change as needed
import rpy2

只要在导入任何rpy2模块之前运行os.environ...代码行，就可以正常使用。

另外，您还可以设置os.environ["R_LIBS_USER"]以使用每个用户的库路径。