在苹果开发者论坛上还没有找到准确的答案。
像其他苹果开发者一样，我将升级我们的应用以支持iOS6设备。我已经下载了支持iOS6 SDK的XCode 4.5。
我知道我不能使用这个XCode版本提交我的应用到应用商店，然而：
如果我使用6.0部署目标重新编译和构建应用程序，并修复所有已知问题（例如弃用的方法等），当苹果发布iOS6 GM时，任何构建是否都能与iOS5设备一起编译和工作？
我是不是应该只提交部署目标为5.0的应用程序，还是这些应用程序将无法在iOS6上运行？
(感到困惑)。
由于这是一个关于支持多个iOS版本的普遍问题，并且不涉及任何iOS6特定事项（被NDA覆盖），所以以下是我的回答：
如果我使用6.0的部署目标重新编译和构建应用程序，并解决所有已知问题，例如弃用方法等。当苹果发布iOS6的GM版本时，任何构建是否都能编译并在iOS5设备上正常运行？
原则上，是的，只要您没有使用任何仅适用于iOS6的功能，或者如果使用了，则必须正确处理（请参见第三个问题的答案）。但是，如果您想确保一切正常工作，测试实际运行iOS5/4设备（或模拟器）几乎是必需的。
也有可能当前在较旧的iOS版本下正常工作的某些内容会在iOS6上出现问题（这可能是因为添加了一些错误，但也可能是因为修复了一些错误，并且发现您的代码存在自己的错误反对前者的影响）。因此，测试至关重要。（感谢rsswtmr的评论）。
如果我将部署目标设置为5.0，那么我只需提交应用程序吗？还是那些无法在iOS6上运行？
如果您的应用程序不使用任何仅适用于iOS6的功能（或者您正确处理了它们），则可以指定部署目标为5.0；换句话说，此设置不会破坏与iOS6的兼容性。
如果我使用新的iOS6功能，我的部署目标是否应该只是iOS6？
它可以这样，但不是唯一的方法。
如果将部署目标指定为iOS6，则可以自由使用应用程序中的任何iOS6-only功能而不必担心。应用商店机制将防止您的应用安装在任何旧设备上，因此您将是安全的。
另一方面，如果将部署目标指定为iOS5或更早版本，则仍然可以在应用程序中使用任何iOS6-only功能，但是应通过“保护”任何使用iOS6-only功能并为iOS5提供后备方案来正确支持旧版本的iOS。
这意味着以下内容：假设您要使用只在iOS6上可用的
featureA，那么您可以做以下几点：
检查在运行时功能是否可用（例如，类响应是否存在等）；
使用#ifdef来保护代码，以便只有在可能时才进行编译；
如果第1步检查失败，则为旧版iOS定义一种退出方式。
将“基础 SDK”设置为最新的 iOS，并将“iOS 部署目标”设置为你计划支持的旧版本（例如iOS 5.0）。
添加条件代码以使用最新 iOS 中可用的功能，而不会在支持的旧版本中崩溃。
这份苹果指南中的“条件编码”部分可能有所帮助。另外，请查看 SO 上其他相关问题。