在Docker容器中定制RStudio环境

Question

在Docker容器中定制RStudio环境

10

我在Windows 10 Pro中的Docker容器中使用RStudio。我使用从https://hub.docker.com/u/rocker/中拉取的RStudio rocker/rstudio映像。

为了启动容器，我执行了以下命令：

docker run -d -p 8787:8787 -v //c/Users/<My name>/Documents/R/Rprojects:/home/rstudio/ rocker/rstudio

然后我可以通过以下链接从浏览器访问服务器： http://localhost:8787/。一切正常。

我想要做的是对RStudio环境进行一些定制。特别是，我将“工具/全局选项/编辑器主题”更改为“Pastel on Dark”。我应用了这个选项，但它只在容器存活时保留。当我重新启动容器时，自定义选项全部丢失。

我的项目保存在运行容器时指定的文件夹中，但全局选项没有保存。

那么，我该如何在硬盘上保存全局选项呢？也许我需要在驱动器上公开另一个文件夹，该文件夹将连接到RStudio保存全局选项的容器文件夹？

是否可以在dockerfile中预定义全局选项作为docker镜像中的新层？

- Alexander

我找到了解决方案。RStudio在我挂载的同一驱动器中创建了特殊文件夹。因此，如果您使用相同的文件夹重新启动容器，则所有自定义设置都将被保留。 - Alexander Borochkin

2个回答

1

为了澄清Alexander在他自己的帖子中的评论：

运行你的容器：docker run -p 8787:8787 -v /home/cummingssg/code:/home/rstudio/code rocker/verse
进入localhost并像平常一样更改RStudio的外观
退出容器：使用control-C或docker stop
查找先前容器的名称：docker ps -a
重新启动容器，它将具有相同的外观：docker start container_name*

(*以step 4最近的项为准，其图像为rocker/verse)

谢谢，Alexander

- SarahGC

问题在于一旦你退出，这个配置就会丢失。 - Kots

网页内容由stack overflow 提供, 点击上面的

可以查看英文原文，
原文链接

- asachet · Accepted Answer

如果你和我一样使用临时容器（使用--rm标志），那么停止时容器将被删除。这是一件好事，因为它确保每次都有100％的清洁环境，但它意味着设置不会从会话到会话保留。

与许多流行的IDE不同，rstudio设置不存储在用户可访问的透明json中，尽管他们正在处理此问题。

一个解决方法是将设置复制到正确的位置：

键绑定：/home/rstudio/.R/rstudio/keybindings/rstudio_bindings.json
常规设置（例如主题）：/home/rstudio/.rstudio/monitored/user-settings

设置步骤如下：

在容器中启动rstudio
设置您所需的设置
将上述2个文件备份到您的主机某处。
每次启动rstudio时复制配置文件-请参见下面的脚本。

我已创建了一个快速启动的快捷方式，指向以下脚本，该脚本很容易适应。它会启动一个名为rstudio的容器，并复制我备份的设置（在我的情况下是从/home/asac/projects/rstudio-config）。

#!/bin/bash                                     
                         
echo Running rstudio on localhost:8787                 
docker run -d --rm -p 8787:8787 -e PASSWORD=<pwd> \                       
-v /home/asac/projects:/home/rstudio/projects \                          
-v /home/asac/data:/home/rstudio/data \                                  
--name rstudio asachet/shiny-dev                                         
                                                                         
echo Copying over rstudio settings                                       
docker exec rstudio mkdir /home/rstudio/.R/rstudio/keybindings -p        
docker cp /home/asac/projects/rstudio-config/user-settings rstudio:/home/rstudio/.rstudio/monitored/user-settings
docker cp /home/asac/projects/rstudio-config/rstudio_bindings.json rstudio:/home/rstudio/.R/rstudio/keybindings/rstudio_bindings.json
                                                                         
echo Launching browser                                                   
xdg-open http://localhost:8787

2020年的新功能

在RStudio v1.3中，有一个新文件~/.config/rstudio/rstudio-prefs.json，它控制所有设置。您可以在机器之间复制它或手动编辑它。

更多详细信息请参见 RStudio Server PR，该功能已在版本1.3中移植到RStudio。