从sqldf查询中调用R函数

Question

有没有办法从sqldf查询中调用R函数？例如：

sqldf("select paste('Hello', 'World')")

或者，是否有一种方法在sqldf后面的SQLite引擎中定义自定义函数或存储过程？（我正在使用带有普通内存R数据框的sqldf；我没有连接到任何实际数据库。）

- Michael Malak

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joran：实际上，我感兴趣的特定函数是来自digest R包的digest()函数，用于计算MD5哈希值。 - Michael Malak

好的，那我同意 @nograpes 的观点。 - joran

如果你想在SQL查询中调用R代码，那么请使用PostgreSQL加上pl/r。如果你想从R中执行此操作，请检查RPostgreSQL包（也可以使用sqldf）。 - dickoa

那么，我想解决方法就是在我的数据框中创建额外的列，例如 mydf["hashedpassword"] <- digest(mydf$password)。 - Michael Malak

糟糕，需要一个sapply：mydf["hashedpassword"] <- sapply(mydf$password, digest(x)) - Michael Malak

Answer 1

1) 现有函数 首先确保你想要的函数已经存在。例如，问题中的代码已经直接在 SQL 中得到了支持：

> sqldf("select 'Hello' || ' ' || 'world' ")
  'Hello' || ' ' || 'world'
1               Hello world

2) RSQLite.extfuns 该包含sqlite SQL的所有SQL函数，还有大量用户定义函数，可以在RSQLite包中的?initExtension列表中直接使用。

3) 其他可加载扩展 任何已存在的sqlite可加载扩展中的函数都可以通过sqlite SQL函数load_extension()来加载。例如，请参见这些扩展。

4) 自定义函数 可以向SQLite添加自定义函数，但必须用C语言编写。请参见此链接。

5) PostgreSQL和sqldf sqldf不仅支持sqlite，还支持h2、postgresql和mysql。其中postgresql在这方面特别强大。请参见postgresql文档中的此链接，以及Pl/R 和R嵌入式Postgres包。

6) H2和sqldf sqldf支持H2数据库。与sqlite一样，H2直接包含在RH2驱动程序R包中，因此您不必安装单独的数据库；但是，您需要安装Java。它有一个内置的SHA256哈希函数（称为hash）。

7) 混合使用sqldf和R SQL和R可以像这样混合使用：

library(digest)
transform(sqldf("select * from BOD"), digest = sapply(demand, digest))

8) 其他 请参见此 SO问题和答案

更新: 添加有关H2的信息。

- G. Grothendieck