Jupyter获取任意笔记本单元格内容

Question

我想从Python中访问笔记本中另一个单元格的文本内容，以便将其提供给单元测试脚本，无论该单元格是否已被执行。这似乎是可能的，但我找不到在IPython内核中执行此操作的正确API。有什么想法吗？ 这个问题问了同样的问题，但我不想使用魔术命令，除非我必须这样做。理想情况下，工作流程应该是“选择小部件选项”，然后是“单击小部件”以使测试运行。

背景：

我正在与一些学生一起教他们Python，在过去，当我这样做时，我设置了一堆单元测试，然后提供了如何通过shell脚本运行测试的说明。然而，我正在与一些没有家庭电脑的学生一起工作，因此我决定尝试使用Jupyter笔记本环境（通过mybinder.org）让他们做同样的事情。通过一些ipywidgets和运行任意代码集上的单元测试的辅助脚本，我已经完成了大部分工作。

- Dustin Spicuzza

Answer 1

就已运行的单元格而言，https://ipython.readthedocs.io/en/stable/interactive/reference.html#input-caching-system所描述的输入输出缓存系统可能会很有用。（其使用示例可参见https://dev59.com/h14c5IYBdhLWcg3wapvz#27952661。）它在Jupyter笔记本中的工作原理如下所示。（相应的笔记本可以在这里查看/访问。）

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因为在下面的评论中@A. Donda提出了关于markdown的问题，所以我在这里添加了nbformat提供的相关功能，可以与已保存的笔记本文件一起使用。使用nbformat读取已保存的笔记本文件允许获取单元格和内容，无论是代码还是markdown，并对单元格是否为markdown或代码进行排序等。我在Jupyter Discourse论坛上发布了许多使用nbformat的示例，可以通过this search here查看列表。它比相关的json.load(open('test.ipynb','r'))命令提供更多实用程序，该命令在here的注释中突出显示，以读取笔记本文件，因为自动包含了额外的笔记本上下文。

- Wayne

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这仅适用于代码单元格，而不适用于文本（Markdown）单元格。 - A. Donda

小提示：_oh 返回单元格调用的输出（与 _、__、_3 相同），而不是在过程中打印或显示的所有内容。可以通过 JS 调用重新获取单元格输出内容。 - Matteo Ferla

@A.Donda 这个问题看起来和你的相关。我在这里加了一个注释，提供了一个相关资源，如果笔记本文件已保存并且知道或可以访问该笔记本文件的名称，则可以获取 Markdown。 - Wayne

Answer 2

如果您想捕获特定单元格的内容以便从另一个单元格中访问它，一种解决方法是在执行该单元格时将其内容写入文件，然后在需要前一个单元格内容的后一个单元格中加载生成的文件（即给出前一个单元格内容的文本）。

可以通过命令“%%writefile foo.py”将单元格内容保存到文件中（在执行相应单元格时），该命令必须放置在单元格的开头。这会导致保存包含上述命令的单元格内容到文件“foo.py”，并且稍后可以再次读取它。

单元格的输出可以更轻松地使用：

只需在单元格的第一行中放置代码“%%capture output”。然后，单元格的输出（在执行后）将作为字符串保存到变量“output”中，并且可以像任何标准Python字符串变量一样使用它。

参考资料： Programmatically get current Ipython notebook cell output?和 https://nbviewer.jupyter.org/github/ipython/ipython/blob/1.x/examples/notebooks/Cell%20Magics.ipynb

- Daniel B.

Answer 3

我找到了一个解决方案，可以获取任何单元格的输出。它需要运行一些JavaScript。

以下是代码，您可以将其放入单元格中并运行它，它将生成一个名为 cell_outputs 的Python变量，其中包含与页面上显示顺序相同的单元格输出的数组。执行此代码的单元格的输出将为空字符串。

%%js
{
    let outputs=[...document.querySelectorAll(".cell")].map(
        cell=> {
            let output=cell.querySelector(".output_text")
            if(output) return output.innerText
            output=cell.querySelector(".rendered_html")
            if(output) return output.innerHTML
            return ""
        }
    )
    
    IPython.notebook.kernel.execute("cell_outputs="+JSON.stringify(outputs))    
}

如果您需要特定单元格的输出，请在Python代码中使用其索引，例如：cell_outputs[2] 访问第三个单元格的输出结果。

我在我的Jupyter笔记本6.0.3上测试过（通过Anaconda社区版最近安装）在Google Chrome浏览器上。上述代码在任何现代浏览器（Chrome、Firefox或Edge）上应该都可以正常运行。

- BenVida

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我们能否在没有 %%js 单元格的情况下运行这段代码？基本上，我有一个库，其中的函数在笔记本Python单元格中被调用。我希望将上述信息放在该库函数内部。 - Djai

不，这个解决方案是基于Javascript的。 - BenVida