使用h5py对象作为实例变量时出现困惑的赋值行为

Question

使用h5py对象作为实例变量时出现困惑的赋值行为

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我正在使用h5py访问HDF5文件并将h5py文件对象存储在一个类中。但是，当我尝试重新分配已关闭的h5py文件实例变量时，出现了一些奇怪的行为：

class MyClass:
    def __init__(self, filename):
        self.h5file = None
        self.filename = filename

    def vartest(self):
        self.h5file = h5py.File(self.filename, 'r')
        print self.h5file
        self.h5file.close()
        print self.h5file
        newh5file = h5py.File(self.filename, 'r')
        print newh5file
        self.h5file = newh5file
        print self.h5file
        print newh5file

def main():
    filename = sys.argv[1]
    mycls = MyClass(filename)
    mycls.vartest()

输出：

<HDF5 file "test.h5" (mode r, 92.7M)>
<Closed HDF5 file>
<HDF5 file "test.h5" (mode r, 92.7M)>
<Closed HDF5 file>
<Closed HDF5 file>

尝试使用新打开的h5py文件对象更新实例变量似乎在某种程度上影响了该对象的状态，从而导致其关闭。无论h5py方面如何实现，我都不明白这种行为如何符合我对Python语言的理解（即没有重载赋值运算符）。这个示例是在Python 2.6.5和h5py 1.3.0上运行的。如果您想尝试此示例但没有HDF5文件，请将文件访问模式从“r”更改为“a”。

- David Eklund

如果您将self.h5file = newh5file代码行注释掉，它是否会打印“closed”？ self.h5file是一个property吗？ h5py.File() 保持一些全局状态吗？ - jfs

如果我注释掉 self.h5file = newh5file，有趣的是，newh5file 和 self.h5file（我明确关闭了）都显示为打开 <HDF5 file "test.h5" (mode r, 800 bytes)>。这个例子是自包含的，self.h5file 不是一个属性。我不能告诉你太多关于 h5py.File() 的实现，我不会感到惊讶如果有一些全局状态，但我不理解如何简单地分配一个实例变量就改变了那个全局状态（某处正在进行引用计数吗？）。 - David Eklund

2个回答

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是的，这是 h5py 1.3 中已知的一个 bug，在使用 HDF5 1.8.5 或更新版本时会出现。它与在 1.8.5 中处理标识符的方式有关。您可以通过使用 HDF5 1.8.4 或更早版本来修复它，或者升级到 h5py 2.0。

- Andrew Collette

谢谢，我会尝试一下。如果你恰好有讨论这个问题的邮件列表帖子或错误报告的参考资料，那将非常有帮助。 - David Eklund

网页内容由stack overflow 提供, 点击上面的

可以查看英文原文，
原文链接

- Ethan Furman · Accepted Answer

不确定这是否有帮助，但是在源代码中搜索，我找到了这个（缩写）：

class HLObject(object):
    def __nonzero__(self):
        register_thread()
        return self.id.__nonzero__()

class Group(HLObject, _DictCompat):
    ...

class File(Group):
    def __repr__(self):
        register_thread()
        if not self:
            return "<Closed HDF5 file>"
        return '<HDF5 file "%s" (mode %s, %s)>' % \
            (os.path.basename(self.filename), self.mode,
             _extras.sizestring(self.fid.get_filesize()))

因为没有__str__方法，所以调用__repr__来生成输出，__repr__首先调用register_thread()，然后检查self是否存活（更好地称为评估为True或False）。

Python然后搜索类，直到找到__nonzero__（再次调用register_thread()），然后返回self.id.__nonzero__()，显然返回False。

所以，你是正确的，问题不在于名称绑定（赋值），而是为什么register_thread和/或self.id出现错误，我不知道。