Matplotlib PDF后端速度慢？

Question

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我正在使用matplotlib将一千个图绘制到PDF上。已经优化了绘图代码，即重复使用figure/axes/lines并只更改y数据。

剩余的大部分时间都花在了save_figure上。

R相比之下似乎可以更快地输出PDF图。在R中，所有零数据的图似乎甚至更快，而在Python中它们的速度相同。

我已经将pdf.compression设置为0，这使得有所改善。

尝试将数据光栅化，对绘图速度没有影响（尽管使用了大量RAM）。

还有什么其他方法可以加速matplotlib对PDF后端的处理，或者是否有任何替代后端可供考虑？我想要超过R。

谢谢！

- peu ping

你是否只能使用 PDF，或者可以尝试使用 EPS/SVG？你是否只能使用矢量图形？ - tacaswell

不限于矢量图形。最终需要PDF格式。如果其他格式速度显著更快，则可以考虑其他格式，但最终需要一种将它们转换为PDF的方法。 - peu ping

你可以尝试将图像导出为eps格式 fig.savefig('blah.eps')，然后使用epspdf进行转换。 - tacaswell

你可以尝试这样做：https://gist.github.com/astrofrog/1453933 - G. Poore

1个回答

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原文链接

- Thorsten Kranz · Answer 1

你尝试过 Gael Varoquaux 的 pyreport 吗？你可以在你的脚本中调用它，然后它会收集所有对 pylab.show() 的调用，制作每个调用的 png 图像，然后从这些图像创建 PDF。

最终它使用了 Latex，所以你需要安装它。但我认为这可能会更快，因为 PDF 的创建被委托给了 Latex。