在Python中如何对正则表达式的输出进行简单的数学运算？

Question

能否对Python正则表达式的输出进行简单的数学计算？

我有一个大文件，需要在跟随")"之后的数字除以100。例如，我将转换包含)75和)2的以下行：

((words:0.23)75:0.55(morewords:0.1)2:0.55);

转换为 )0.75 和 )0.02:

((words:0.23)0.75:0.55(morewords:0.1)0.02:0.55);

我的第一反应是使用re.sub函数，使用搜索表达式"\)\d+"，但我不知道如何将括号后面的整数除以100，或者是否可以使用re实现。

你有什么想法解决这个问题吗？感谢你的帮助！

- chimeric

---

你尝试过将字符串转换为整数吗？ - erbridge

正则表达式用于文本操作。为了实现这一点，我认为不得不将字符串转换为整数，然后再除以100。 - andrefsp

顺便提一下，这看起来像是 Newick 格式（除了在 Newick 格式中，像“words”或“morewords”这样的单个节点通常不会有引导置信度）。您可能会更轻松地使用 Newick 解析器执行其他操作，例如 BioPython 中的解析器，而不是使用正则表达式。 - David Robinson

是的，你说得对--我正在将Newick树中的自举值除以100。谢谢建议。 - chimeric

Answer 1

您可以通过提供一个函数作为替换来完成它：

您可以通过提供一个函数作为替换来完成它：

s = "((words:0.23)75:0.55(morewords:0.1)2:0.55);"

s = re.sub("\)(\d+)", lambda m: ")" + str(float(m.groups()[0]) / 100), s)

print s
# ((words:0.23)0.75:0.55(morewords:0.1)0.02:0.55);

顺便提一下，如果您想使用 BioPython 的 Newick 树解析器 来完成此操作，则代码如下：

from Bio import Phylo
# assuming you want to read from a string rather than a file
from StringIO import StringIO

tree = Phylo.read(StringIO(s), "newick")

for c in tree.get_nonterminals():
    if c.confidence != None:
        c.confidence = c.confidence / 100

print tree.format("newick")

虽然使用这种特定的操作所需的代码行数比正则表达式版本要多，但涉及树的其他操作可能会更容易实现。

- David Robinson

Answer 2

< p > < code > re.sub 的替换表达式可以是一个函数。编写一个函数，它接受匹配的文本，将其转换为数字，将其除以100，然后返回结果的字符串形式。

- BrenBarn