分发使用外部包的R脚本

Question

我正在与大多数非技术用户组成的小团队中工作，并希望在团队内部分发一个R脚本。该脚本在shebang行中使用“RScript”，需要一些命令行参数，并生成一个图形文件和一些文本作为输出。

我想知道是否有办法确保脚本使用的任何外部包（即使是用于解析参数的optparse之类的东西）可供用户使用。我预计团队中的每个人都能按照说明从命令行调用程序，但要求人们启动R并下载和安装依赖项可能太过繁琐。我曾经在Python中的类似情况下使用过py2exe或py2app，但我想知道是否有等效的方法或至少是最佳实践来分发R脚本。

- primelens

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当你说“libraries”的时候，你是指“packages”吗？ - Spacedman

是的。对不起，术语可能有些模糊。 - primelens

Answer 1

创建一个包，在DESCRIPTION中声明依赖项为Depends。这是可行的，并在各种操作系统上进行了广泛测试。

您还可以将包放置在本地存储库中，使更新更加容易且可能自动完成。我曾经编写过一个公司内部的包，在其自身的启动代码中检查本地存储库是否有更新版本可用。

- Dirk Eddelbuettel

Answer 2

Dirk提供了最佳实践解决方案（带依赖的软件包），但下一个最佳实践解决方案可能是使用require(foo)并测试软件包是否存在，如果不存在，则获取它。类似于：

if(require(foo)){
 # foo loaded okay
 cat("we got foo\n")
}else{
 cat("uh oh, no foo. let's get it\n")
 install.packages("foo")
}

您可能希望在install.packages中指定一个CRAN仓库，以免用户被询问，并且在require中使用一些选项来停止警告。

- Spacedman

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好的回答。此外，除了Dirk的建议之外，人们还可以指定本地存储库/服务器，这样就不需要访问CRAN了。如果使用本地服务器，则管理员可以指定自动更新内部派生包或套件，以确保安装的一致性。如果用户具有不同版本的软件包，则可能会出现一些问题，如果其中一个崩溃或者没有很好地测试所有内容的行为方式，那么这将是一个噩梦。 - Iterator