使用networkx绘图时出现“_AxesStack”对象不可调用的错误。

Question

在一个在线教程中，我发现即使是很小的一段文字也很难运行。

这是我想写入图形的内容：一个有向无环加权矩阵，但是我遇到了矩阵表示和图片表示的问题。前者给出一个警告，并用数组替换输出矩阵。然而，图片绘制总是只输出错误，我不知道为什么。以下是我的代码：

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib
matplotlib.use('TkAgg')
import numpy as np
A = np.array([[0,1,1,0],
              [1,0,1,1],
              [1,1,0,0],
              [0,1,0,0]])
G=nx.from_numpy_array(A)
nx.draw(G,with_lables=True)

我的networkx版本是2.8.4，matplotlib版本是3.6.0，与教程提到的版本相匹配。下面是错误信息：

'_AxesStack' object is not callable

- Leonhart Dreyse

Answer 1

开始使用

nx.draw_networkx(G, with_labels=True)

替代

nx.draw(G, with_labels=True)

- Mohamad Sobhi

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请您能否添加一些解释？ - AndreP

Answer 2

draw() 支持的参数是 with_labels。请修正您的拼写错误。

该错误已在 networkx 的 GitHub 仓库中的this线程 中讨论，并建议使用 matplotlib 3.6.0rc1 的用户将 networkx 更新到其最新版本。

在修正了拼写错误并使用了 networkx 版本 2.8.7 和 matplotlib 版本 3.5.1 后，代码生成以下图形：

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编辑:

如果您正在使用networkx v3.1，并且不希望降级Matplotlib，请考虑Mohamad Sobhi的这个答案。

- medium-dimensional

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非常感谢您的建议！在我将matplotlib包降级到3.5.1之后，错误消失了。但是，仍然有两个问题。第一个问题是图片是否只能在jupyternotebook中显示？当我使用pycharm时，我只能看到程序成功运行，但没有图片。第二个问题是，当我点击“file->settings->Python Interpreter”时，显示的最新版本是2.8.4，没有2.8.7。这是pycharm还是anaconda或其他一些东西的问题？ - Leonhart Dreyse

实际上我想投票支持你的回答，但遗憾的是网站告诉我只有在获得15个积分后才能进行投票。很遗憾，但还是感谢你的回答。 - Leonhart Dreyse

@LeonhartDreyse 您可以更新两个软件包（matplotlib和networkx）-我认为您不会在最新版本中遇到错误。此外，我没有在Jupyter Notebook中创建此图 - 直接使用.py脚本。您使用Python 2.x版本的原因是什么？此答案是使用Python 3.9.13创建的。 - medium-dimensional

你是不是想说Pycharm显示的是networkx v2.8.4而不是v2.8.7？ - medium-dimensional

降级 matplotlib==3.5.1 解决了这个问题！ - Wei Shan Lee

Answer 3

这个错误与matplotlib的一个已弃用特性有关。问题是因为您正在运行networkx版本2.8.4。(现在最新的稳定版本是ver. 3.0.0)。

根据您的解释，我想您正在使用conda环境，您可以在https://anaconda.org/conda-forge/networkx找到它。但最新版本仍然是2.8.4。

我认为您问题的解决方案如下：

1. 从conda环境中删除networkx包（conda uninstall networkx）
2. 不要使用conda install，而是使用pip install（pip install networkx）
3. 验证您当前的networkx版本是否已更新至ver 3。

- Alif Nur Iman

Answer 4

我没有足够的声望直接评论@medium-dimensional。但是请检查一下您是否在pycharm中使用conda管理您的环境。在遇到相同问题后，我意识到通过conda安装的最新版本仍然是2.8.4（直到本回复的当天）。

我的建议是尝试运行

conda activate <your env> 
pip install --update networkx

pip 应该会检测到您已经安装了该软件包，并将在该位置更新到 3.0 版本

- avalencia

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你为什么要同时使用两个包管理器呢？ - Ari