如何在Emacs中使用GDB调试带有C代码的R包？

Question

我目前正在编写一个R包，并使用Rcpp包中的编译C++代码（对于像我这样的非程序员，Rcpp使得R和C ++代码的交互更加容易，个人认为）。

我想使用gdb调试我的C++程序中的一些错误。我已经在谷歌上搜索到了一些关于在emacs中调试R的资源，如R-FAQ、一些邮件在这里，当然还有R的撰写R扩展手册。

然而，由于我是第一次这样做，因此无法深入了解。是否有人可以给我一些指导，告诉我如何在emacs中调试R包（或带有C ++ / C代码的扩展）。具体来说，我想利用使用ESS与Emacs的gdb（因为R-FAQ提到了这一点）。

请注意，我知道如何仅使用C或C ++程序使用gdb。但我无法将此知识转化为使用gdb进行R和扩展。

- suncoolsu

Answer 1

你可以利用RInside（与Rcpp配合得非常好）将调试C++程序的问题转化为纯C++开发和调试任务，从而利用你现有的C++编程知识。

编写一个main() C++函数，使用RInside创建一个R实例，执行R代码（或源R脚本）设置测试用例，然后从main()中调用被测试的函数。

#include <Rcpp.h>
#include <RInside.h>
#include "function_under_test.h"

int main(int argc, char *argv[]) 
{
    using namespace std;
    using namespace Rcpp;

    RInside R(argc, argv);

    string evalstr = R"(
        a <- matrix(c(1,1,1, 1,1,1, 1,1,1), nrow = 3, ncol=3)
    )";
    R.parseEvalQ(evalstr);

    SEXP a = R["a"];

    R["b"] = function_under_test(a);

    evalstr = R"(
        print(b)
    )";
    R.parseEvalQ(evalstr);

    return 0;
}

然后，像以往一样使用gdb调试C++程序，通过在function_under_test()等位置设置断点。

这样做可以避免在R和C++开发环境之间切换，并且不必重新安装R包。

- Christian David

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@user39275：C++11支持原始字符串（用“多余”的R表示），这对于封装多行R语句非常有用。这避免了手动转义换行符的麻烦。 - Christian David

Answer 2

很不幸，这并不是那么容易的。你需要在ESS、gdb（即Emacs中的gud）和R之间跳转。最好的描述可能仍然是《编写R扩展》（Writing R Extensions），但是最近的主题在ESS邮件列表上也讨论了这个问题（请注意，有些回复在主题之外，因此请查看邮件列表存档）。

- Dirk Eddelbuettel

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谢谢。不幸的是，我就是您提到的那个帖子中提问的新手（由Bates教授提出，Maechler教授回答）。 :-(。 - suncoolsu

我使用命令行中的 R -d gdb，然后输入 r 告诉 gdb 运行 R，再输入 library(pkg)，然后按 ctrl-c 进入 gdb，设置断点等操作，没有用 emacs。对我来说，记住符号名称和程序逻辑已经很具有挑战性了，不需要去记忆 emacs / ESS 层。 - Martin Morgan

我认为这是在编写R扩展中提到的方法，不是吗？ - Dirk Eddelbuettel

此外，我发现在构建R时不进行优化并使用-ggdb调试标志非常有帮助（R扩展程序也可能建议这样做）。在命令提示符下输入：CFLAGS="-ggdb" CXXFLAGS="-ggdb" FFLAGS="-ggdb" ./configure --enable-R-shlib - Jeff