在Rstudio中设置Quarto文档的目录

Question

在Rstudio中设置Quarto文档的目录

directoryr-markdownrstudioquarto

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我目前正试图从Rmarkdown转向Quarto。但是，我在设置正确的项目目录方面遇到了问题。我想问一下，在Quarto中是否有类似于Rmarkdown中这个选项的东西。

我的理解是，我需要制作一个.yml文件来指定我想要使用的目录，对我来说不是很直观。

- Abdullah Abdelaziz

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你可以在一个新目录中创建一个新项目，并创建一个新的Quarto文件。 - Daniel_j_iii

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是的，我知道，但我想知道是否有一种方法可以在文件本身中灵活地编辑Quarto文件渲染输出目录，而不使用单独的配置文件。 - Abdullah Abdelaziz

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也许可以看一下 here 包，它可以将所有路径都相对于项目根目录。 - Richard Telford

已经过了几个月了，你有没有关于如何使这个工作的任何更新？ - kputschko

我没有资格评论。这是一个链接，指向@pablo-velázquez引用的quarto文档：https://quarto.org/docs/books/book-output.html#output-path - undefined

5个回答

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你可以使用 output-file:，例如：output-file: Projects/index.qmd，这将把当前文件保存到目录中，但需要一定的父/子级和绝对/相对路径基础知识。

目前这是一个空目录。

然后是一个简单的例子：

---
output-file: test/index.qmd
---

然后将文件呈现到指定目录。

请注意，我的delete.qmd文件保存在桌面上，然后我将其输出到/test目录中的另一个文件，并让Quarto将输出保存为另一个文件名。这不需要另一个YAML文件，我们使用内联YAML。

- Daniel_j_iii

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非常有帮助，谢谢！我的问题实际上不在于输出，而是关于调用或者调用文件。例如，我想把delete.qmd保存在一个叫做scripts的文件夹中，而这个scripts文件夹是我的R项目的一部分。假设我正在处理delete.qmd，并且我想通过编写read_csv("data/something.csv")来调用位于名为data的文件夹中的something.csv文件，该文件夹也在我的项目目录中。我希望这样做。从我看到的情况来看，除非data文件夹位于存储Quarto文件的同一文件夹中，否则不可能实现。 - Abdullah Abdelaziz

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你可以在文档的YAML中添加全局的knitr选项：

---
title: "My Document"
format: html
knitr:
  opts_knit:
    root.dir: "c:/my/project/directory"
---

- Mike O'Brien

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我尝试了这个，但它没有起作用。仍需在块内使用 knitr::opts_knit$set(root.dir = '/path/to/dir') ... 有什么想法吗？ - Dijkie85

显然相关文档：https://quarto.org/docs/books/book-output.html#output-path - undefined

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有点晚了，但我是这样解决的：

直接从RStudio创建一个Quarto项目（转到文件：新建项目...命令，指定新目录，然后选择Quarto项目）。
当你的Quarto项目被创建时，它会有一个"_quarto" YAML文件。
用文本编辑器打开它，并在标题下面添加下一行： output-dir: output
在你的Quarto项目中创建一个名为"output"的新目录。
你的文件将呈现在新的"output"目录中！

- Pablo Velázquez

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另一个选择是使用：

quarto::quarto_render(here::here("path_to/doc.qmd"),
                      execute_dir = here::here(),
                      output_format = "all", as_job = TRUE)

我正在使用这个工具以多种格式输出结果，并发现设置execute_dir可以使文件路径正常工作。

- see24

网页内容由stack overflow 提供, 点击上面的

可以查看英文原文，
原文链接

- shafee · Accepted Answer

你可能想使用{here}包，它非常适用于在项目中处理文件路径。

假设我已经通过在Rstudio中依次执行文件 -> 新建项目 -> 新建目录 -> Quarto 项目创建了一个quarto项目，并在其中创建了一些文件夹和文件。因此，我的当前项目结构如下：

$
│ test_proj.Rproj
│ _quarto.yml
│
├─-data
│    mtcars.csv
│
└─-scripts
     delete.qmd

现在要从delete.qmd调用mtcars.csv文件，您可以执行以下操作。

---
title: "Test File"
format: html
---

## Quarto

```{r reading-data}

df <- read.csv(here::here("data/mtcars.csv"))
```

根据here::here()的文档，它将始终定位到与您的项目根目录相关的文件。因此，在以项目根目录（其中包含test_proj.Rproj）为基础的思考中，您可以在qmd或R-script文件中将mtcars.csv的路径写为"data/mtcars.csv"，而无论脚本文件在哪里，因为您正在相对于固定的项目根目录调用csv文件。如需了解更多关于{here}的信息，请参见此处。