eigen_centrality{igraph}导致R崩溃

Question

eigen_centrality{igraph}导致R崩溃

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我试图使用 eigen_centrality{igraph} 来计算网络中节点的特征向量中心性（Eigenvector Centrality）得分。但是每次运行该命令时，Rstudio 都会崩溃。我也在普通的 R 中尝试过，但同样崩溃。

我正在使用 Windows 10。我已经尝试重新安装库，但没有成功。

library(igraph)

# sample graph
  g <- sample_gnp(10, 2/10); E(g)$weight <- runif(ecount(g))

# get eigen centrality
  eigen <- eigen_centrality(g, directed = T, weights = E(g)$weight, scale = T)

它在我使用库文档中提供的示例时也会崩溃。

# Generate some test data
  g <- make_ring(10, directed=FALSE)

# Compute eigenvector centrality scores
  eigen_centrality(g)

额外信息:

我在Mac OS上遇到了同样的问题，想要提高此问题的优先级。我也尝试卸载并重新安装igraph，但没有成功。

$ R
R> library(igraph)
R> #Generate some test data
R> g <- make_ring(10, directed=FALSE)
R> #Compute eigenvector centrality scores
R> eigen_centrality(g)
Fortran runtime error: Insufficient number of elements in TARRAY.
$
$ echo $?
2
$
$ R
R> library(igraph)
R> sessionInfo()
R version 3.4.2 (2017-09-28)
Platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit)
Running under: macOS High Sierra 10.13.4

Matrix products: default
BLAS: /System/Library/Frameworks/Accelerate.framework/Versions/A/Frameworks/vecLib.framework/Versions/A/libBLAS.dylib
LAPACK: /System/Library/Frameworks/Accelerate.framework/Versions/A/Frameworks/vecLib.framework/Versions/A/libLAPACK.dylib

locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] igraph_1.2.2

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.4.2  magrittr_1.5    pkgconfig_2.0.2
R> R.version
               _                           
platform       x86_64-apple-darwin13.4.0   
arch           x86_64                      
os             darwin13.4.0                
system         x86_64, darwin13.4.0        
status                                     
major          3                           
minor          4.2                         
year           2017                        
month          09                          
day            28                          
svn rev        73368                       
language       R                           
version.string R version 3.4.2 (2017-09-28)
nickname       Short Summer                
R>

- rafa.pereira

我今天（20200315）又使用了这段代码，它运行良好。似乎igraph的某个更新已经修复了问题，因此我将关闭此问题。 - rafa.pereira

1个回答

网页内容由stack overflow 提供, 点击上面的

可以查看英文原文，
原文链接

- user12 · Answer 1

在我的4GB电脑上，Windows 8上运行良好。显示以下输出：eigen_centrality(g)

     $vector
         [1] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
    
    $value
    [1] 2
    
    $options
    $options$bmat
    [1] "I"
    
    $options$n
    [1] 10
    
    $options$which
    [1] "LA"
    
    $options$nev
    [1] 1
    
    $options$tol
    [1] 0
    
    $options$ncv
    [1] 0
    
    $options$ldv
    [1] 0
    
    $options$ishift
    [1] 1
    
    $options$maxiter
    [1] 1000
    
    $options$nb
    [1] 1
    
    $options$mode
    [1] 1
    
    $options$start
    [1] 1
    
    $options$sigma
    [1] 0
    
    $options$sigmai
    [1] 0
    
    $options$info
    [1] 0
    
    $options$iter
    [1] 5
    
    $options$nconv
    [1] 1
    
    $options$numop
    [1] 17
    
    $options$numopb
    [1] 0
    
    $options$numreo
    [1] 14

通过使用以下命令检查分配给 R 的内存：memory.limit()。