.Rprofile使用后仍会加载R默认包

Question

我在RGui/RStudio中使用R 3.5.1，并在用户主目录中使用'.Rprofile'文件，其中只有一个条目来预加载'tidyverse'包：library(tidyverse)。

当想要使用'dplyr'包的filter()函数时，它会被已经作为默认包加载的'stats'包的filter()函数掩盖，而这个过程发生在R启动过程中源代码'.Rprofile'之后。

这种行为似乎与?Startup所告诉我们的相矛盾：“请注意，在源代码网站和用户配置文件时，只有基本包被加载，因此需要通过例如utils::dump.frames或在显式加载相关包之后引用其他包中的对象。”

请问有人能告诉我，为什么即使使用用户配置文件，也会加载默认包如'stats'吗？非常感谢！

- Gregor Kvas

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几个问题：1. 当您使用dplyr filter()时，它是否有效？2. 您的.Rprofile文件是否与其他库（例如stats）位于同一文件夹中？这很奇怪，因为我一直能够在加载stats包时使用dplyr filter()。 - Pryore

抱歉回复晚了！广告1：当通过在项目文件夹中加载“.Rprofile”时，先加载{dplyr}，然后加载{stats}时，{dplyr} filter()不起作用，这很奇怪，因为由于“？Startup”，R只应该加载{base}。广告2：不，我的“.Rprofile”在Windows“文档”文件夹中的项目文件夹中，库{stats}在R文件夹“C:\Program Files\R\R-3.5.1\library\stats”中。是的，当{dplyr}在{stats}之后加载时，{dplyr} filter()总是有效的。 - Gregor Kvas

Answer 1

我的问题已经在这里得到了回答：R dplyr filter not masking base filter? [duplicate]

如前所述，?Startup 的文档说明：

请注意，当源代码文件和用户配置文件被引用时，只有基本包会被加载，因此需要通过例如 utils::dump.frames 或显式加载相关的包来引用其他包中的对象。

不幸的是，这可能会被误解，因此最初导致了我的问题。短语“只有基本包被加载”的意思是，在启动过程中只有 base 包将作为第一个被加载的包，但是其他默认包（如 stats）将在源自用户 .Rprofile 文件的包之后被加载。

这就是为什么在启动过程中在用户 .Rprofile 文件中加载的 dplyr 包的 filter() 函数会被默认包 stats 的 filter() 函数掩盖的原因。

- Gregor Kvas

Answer 2

.Rprofile 在 R 加载基本库之前运行 首先加载 stats 包

library('stats', warn.conflicts = TRUE, verbose = TRUE) 
library('dplyr', warn.conflicts = TRUE, verbose = TRUE)

- Captain Tyler