如何使用.yml文件更新现有的Conda环境

Question

如何使用另一个.yml文件更新已存在的conda环境。当处理有多个需求文件（例如base.yml, local.yml, production.yml等）的项目时，这非常有帮助。

例如，下面是一个包含conda-forge、conda和pip软件包的base.yml文件：

base.yml

name: myenv
channels:
  - conda-forge
dependencies:
  - django=1.10.5
  - pip:
    - django-crispy-forms==1.6.1

实际环境是通过以下命令创建的：conda env create -f base.yml。

之后，需要添加其他软件包到base.yml。另一个文件，比如说local.yml，需要导入这些更新。

以前尝试过的方法包括：

创建一个带有导入定义的local.yml文件：

channels:

dependencies:
  - pip:
    - boto3==1.4.4
imports:
  - requirements/base. 

然后运行以下命令：conda install -f local.yml。

这并没有起作用。有什么想法吗？

- user6536435

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能否更新当前激活的环境？我刚试过了，但是更新操作会应用到 yml 文件中指定的环境。 - Soren

这可能对从头开始很有用：conda env create -f ~/CoqGym/coq_gym.yml（参见：https://dev59.com/ELHma4cB1Zd3GeqPNZCR） - Charlie Parker

Answer 1

尝试使用conda env update：

conda activate myenv
conda env update --file local.yml --prune

--prune 卸载从 local.yml 中删除的依赖项，如 @Blink 在 this answer 中指出的。

注意：如果在 local.yml 中有一个名称不同于您的环境名称的 name 标签，则上述命令将创建一个新的具有该名称的环境。为避免这种情况，请使用以下命令（感谢 @NumesSanguis）：

conda env update --name myenv --file local.yml --prune

请参阅 Conda 用户指南中的 更新环境。

- alkamid

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在-f和file.yml之间不需要等号。移除等号将使得在yml文件名上使用制表符自动补全功能。 - BallpointBen

在local.yml中添加 --name env_name 来忽略任何 name: foo 标签。这还可以避免先激活 myenv。完整命令：conda env update --name env_name --file local.yml。 - NumesSanguis

最新版本的conda中，我认为我们使用“conda activate myenv”而不是“source activate myenv”。 - lightbox142

确保YAML文件没有name参数，否则使用此update命令会创建它。 - Dima Lituiev

@DimaLituiev，您能澄清一下“否则它将使用此更新命令创建”的意思吗？如果名称已经存在会有什么问题吗？另外，底部的前缀词会创建问题吗？ - Charlie Parker

Answer 2

建议的答案部分正确。您需要添加--prune选项，以卸载从environment.yml中删除的软件包。 正确的命令：

conda env update -f local.yml --prune

- Blink

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即使使用了 --prune 参数，也不足以移除通过 pip 安装的依赖包... - Jean Paul

正确。我认为它会删除conda依赖项，但不会删除在pip下列出的依赖项。 - Blink

有没有办法可以传递一个参数，使得该命令只会更新.yml文件中可用的库，从而确保在任何列出的库不可用时不会抛出错误？ - dan

如果我的 requirements.yml 文件顶部有一个 name:，会出现问题吗？ - Charlie Parker

Answer 3

alkamid的回答是正确的，但我发现如果环境已经激活，Conda无法安装新的依赖项。先停用环境可以解决这个问题:

source deactivate;
conda env update -f whatever.yml;
source activate my_environment_name; # Must be AFTER the conda env update line!

- Dave

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如果当前活动的环境不是要更新的环境，conda 如何知道要更新哪个环境？ - Thomas Fauskanger

@ThomasFauskanger，您可以使用“-n <环境名称>”来明确指定它，但默认情况下它似乎与预期的环境一起工作（可能是最近活动的环境，或者只是一个默认的环境选择）。 - Dave

@ThomasFauskanger 如果环境已由conda导出，则环境的名称在YAML文件中指定。 - Thomas

我认为这个问题的旧观点是将一个不同的环境更新到yaml文件中指定的环境。 - Giacomo

@ThomasFauskanger yaml文件包含了环境名称。 - Abdulrahman Bres

Answer 4

最近，Conda引入了堆栈环境的选项，这应该能解决这个问题。

- seali33