您可以尝试使用Ghostscript（但要使用最新版本，如9.05）“修复”您的pdftk合并PDF。在许多情况下，Ghostscript将能够将许多子集字体合并为较少数量的字体。
命令如下：
gswin32c.exe ^
-o output.pdf ^
-sDEVICE=pdfwrite ^
-dPDFSETTINGS=/prepress ^
input.pdf
请检查
pdffonts.exe output.pdf
pdffonts.exe input.pdf
每个文件中各种字体子集的实例数（
pdffonts.exe可在
此处作为一小部分
命令行工具包中获得）。
但是不要抱怨这个过程的“缓慢”——Ghostscript需要完全解释所有PDF输入文件以完成其任务，而pdftk文件连接则是一个更简单的过程...
更新：
您可以使用Ghostscript代替
pdftk来合并输入的PDF文件。这可能可以避免您在后期使用Ghostscript对您的pdftk合并文件进行“修复”时所看到的问题。请注意，
这会比“愚蠢的” pdftk 合并慢得多。但是，结果可能更加令人满意，特别是涉及字体处理和文件大小方面。
下面是一个可能的命令：
gswin32c.exe ^
-o output.pdf ^
-sDEVICE=pdfwrite ^
-dPDFSETTINGS=/prepress ^
input.pdf
您可以在Ghostscript CLI中添加更多选项，以更精细地控制合并和优化过程。最终，您将不得不在以下极端之间做出决定：
- '快速'的
pdftk生成大型输出文件，与
- '缓慢'的
gswin32c.exe（Ghostscript）生成瘦身的输出文件。
如果您能为一些合并过程的两种方法发布一些结果（执行时间和生成的文件大小），我会很感兴趣...
更新2：抱歉，我的先前版本中有一个错别字。不是
-sPDFSETTINGS=...，而是必须是
-dPDFSETTINGS=...（在
s的位置上使用
d）。
更新3：由于您的源文件是从模板创建的Excel表格（通常不使用许多不同的字体），因此您可以尝试使用一个技巧，以确保Ghostscript具有稍后要合并的所有PDF中使用的字体的所有所需字形：
- 对于每个字体和字形（标准、斜体、粗体、粗斜体），在您的模板工作表的左上角添加一个表单元格，该单元格位于您的打印区域的左上角。
- 使用ASCII字母表中的所有可打印字符和标点符号填写此表单元格：
0123456789、
ABCD...XYZ、
abc...xyz、
:-_;°%&$§")({}[]等。
- 将单元格（和字体大小）缩小到您需要的任何大小，以便不会干扰整体布局。使用白色来格式化单元格中的字符（这样它们在最终PDF中看起来是不可见的）。
这种方法有望确保每个PDF都使用相同的字形子集，从而避免您在使用Ghostscript合并文件时观察到的问题。（
请注意，如果您使用Arial和Arial-Italic等，则必须创建2个这样的单元格：一个用标准Arial字体格式化，另一个用斜体格式化。）
pdffonts input.pdf的输出结果，以及为pdftk从相同的输入集创建的文件添加pdffonts output.pdf的输出结果？ - Kurt Pfeifle