R/RStudio、Yosemite和Java

Question

我昨天升级到了OSX Yosemite系统。当我在RStudio中运行library(xlsx)时，程序会崩溃并显示以下信息：“要打开‘RStudio’，您需要安装旧版的Java SE 6运行环境。”当我在R中运行library(xlsx)时，同样会得到相同的结果和关于打开R的信息。

以下是我的详细信息：

Mac Yosemite, Version 10.10.2
R version 3.1.2 (2014-10-31) 
Platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit)

我有Java 8更新31版本。我运行了java -version 命令，收到此消息："未找到Java运行时，请请求安装。" 因此我安装了Java SE Development Kit 8u31。现在：

java -version
java version "1.8.0_31"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.8.0_31-b13)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 25.31-b07, mixed mode)

这并没有解决问题，因为运行 library(xlsx) 仍会导致程序崩溃并抛出警告。我需要回滚到 Java SE 6 运行时版本，还是有办法使用我安装的最新版本？

这篇 SO 帖子 似乎与此有关，但我不确定安装Java 6的建议解决方案。答案链接到一个看起来已经过时的苹果支持页面。

我对Java不熟悉，所以需要一些建议。

- Eric Green

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你也可以（从Terminal.app）使用“open -a RStudio”命令（前提是你的环境变量都设置好了），它也可以很好地与较新的JVM一起使用。 - hrbrmstr

Answer 1

如果你安装的Java版本不行，请下载这个版本。

https://support.apple.com/kb/DL1572?viewlocale=en_US&locale=en_US

安装后，您的问题将得到解决。

- user1267127

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@Eric Green 欢迎！Eric，如果我是你，我不会升级到Yosemite，天哪，它带来了这么多问题。欢迎来挑战 :-D - user1267127

我以为我等了足够长的时间来解决这些问题。悲哀！ - Eric Green

@Eric Green 我个人降级到了Mavericks！如果你也决定这么做，不要犹豫发表评论，我会告诉你如何操作 :-) - user1267127

@Nemo 我也遇到了同样的问题。这是否意味着问题来自于OS X？我本以为是R或RStudio的问题...我真的不想安装这么旧的Java版本。 - LudoMC

@LudoMC 这显然是Java 1.8的一个bug。请参见https://github.com/s-u/rJava/issues/37和https://bugs.openjdk.java.net/browse/JDK-7131356。 - leekaiinthesky

是的，这会捣乱所有其他实际上需要 Java 8 的应用程序，例如Bamboo...因此，通过“解决”一个问题，您创造了一系列其他问题。使用Java，大多数问题不能被保持在一个整洁的沙箱中。对某个操作系统版本的个人怨恨应该被从评论中排除出去。@leekaiinthesky的评论更有帮助。 - yogibimbi

Answer 2

这对我有用：在~/.profile中设置两个环境变量。

export JAVA_HOME=`/usr/libexec/java_home -v 1.8`
export LD_LIBRARY_PATH=$JAVA_HOME/jre/lib/server

我可以在Rstudio中安装rJava和xlsx软件包。不过，说实话，这需要花费数小时来进行琢磨（毫无头绪地）。

- awfulHack

Answer 3

我已经成功加载了Java 8的rJava。看起来这是RStudio在Yosemite中未能将某些环境变量传递到其rsession的问题。希望他们很快就会解决，但在此期间，您可以在终端中自己传递环境变量。运行以下命令： $LD_LIBRARY_PATH=$(/usr/libexec/java_home)/jre/lib/server: open -a RStudio 基本上，您在此处运行java_home可执行文件，它返回您的Java路径，然后附加jre/lib/server目录。这被分配给LD_LIBRARY_PATH，这是RStudio需要正确工作的内容。

- Dr. Arun