贝叶斯网络库

Question

大家好，作为标题所示，我正在寻找学习和推断贝叶斯网络的库。我已经找到了一些，但希望能够得到推荐。

以下是快速概述的要求:

• 最好使用Java或Python编写
• 可以通过代码进行配置（包括网络本身）
• 必须提供源代码
• 项目仍在维护中
• 越强大越好

你推荐哪一个呢？

- steffen

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我是 OP，我已经投票删除了这个问题，因为保持 SE 网站的清洁也是我的个人目标。 - steffen

Answer 1

请看一下Weka。在我所在的地区，这个工具很受欢迎……它是开源的，用Java编写。

这份文档将告诉你有关Weka中贝叶斯网络的内容，摘要如下：

• 使用各种爬山（K2、B等）和通用（模拟退火、禁忌搜索）算法进行贝叶斯网络结构学习。
• 实现了局部得分指标：贝叶斯、BDe、MDL、熵、AIC。
• 实现了全局得分指标：留一交叉验证、k折交叉验证和累积交叉验证。
• 提供基于条件独立性的因果推断算法。
• 使用直接估计和贝叶斯模型平均法进行参数估计。
• 提供图形用户界面，便于检查贝叶斯网络。

- Dr G

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Weka确实很强大，但是定义网络结构的复杂程度并不清楚，而非学习它。 不过手册表明这是可能的。 (+1)感谢提供bn手册的链接。(离题：有兴趣参加stats.stackexchange吗？我们需要更多的机器学习者;) - steffen

我发现Weka的学习曲线相当陡峭，但我认为这是值得的。我确实在stats.stackexchange上，只是不太活跃 :) - Dr G

Answer 2

所以我给出我的主观答案。从我的经验来看，与统计学相关的所有事情都最好用R解决。我经常看到，在与统计学相关的领域中，R拥有最多的库，并且往往实现了最先进的算法/方法。

像我这样的大多数程序员喜欢使用他们已知道的语言，并且学习新的东西是一种权衡，主要因为它耗费时间。

因此，如果学习一门新语言是可行的选择，那么在我看来，R是一个不错的选择，甚至是最佳的选择。

简要查看与贝叶斯网络和贝叶斯推断相关的R库。

Bayesian: http://cran.r-project.org/web/views/Bayesian.html 图形模型： http://cran.r-project.org/web/views/gR.html 机器学习： http://cran.r-project.org/web/views/MachineLearning.html R的主要优点：
- 安装库很容易：install.packages("RWeka")
- 所有库的帮助格式和样式都是相同的
- 如果您了解R，很容易从一个库切换到另一个库。因此，可以轻松测试所有可用的库，然后使用最适合的库

- mrsteve

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谢谢您的回复。我实际上知道R语言，但有时候问题不仅在于哪种语言最好，而且还要考虑是否要将另一种语言引入到现有环境中（这意味着必须训练多个人使用该语言）。我有我的理由询问Java，但无论如何感谢您提供的链接。我之前并不知道它们。 - steffen

Answer 3

我从未使用过它，但也许MALLET库适合您的需求？

- Stompchicken

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(+1)：没有找到那个。看起来很有前途。 - steffen

Mallet本身在自然语言处理方面非常受欢迎。虽然我没有使用过它，但它似乎很可靠，正在积极开发，并且文档相当完善。不过，图形模型似乎是附加在主包中的。 - Stompchicken

@StompChicken 我们如何使用Mallet创建贝叶斯网络？ - Siten