由于 "gdal" 的问题，安装 "sf" 出现了麻烦。

Question

我无法在R上安装"sf"包。看起来与gdal有关的问题。不知道如何解决。

> install.packages("sf")

  There is a binary version available but the source version is later:
   binary source needs_compilation
sf  0.4-3  0.5-1              TRUE

Do you want to install from sources the package which needs compilation?
y/n: y
installing the source package ‘sf’

trying URL 'https://cran.rstudio.com/src/contrib/sf_0.5-1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 4073881 bytes (3.9 MB)
==================================================
downloaded 3.9 MB

* installing *source* package ‘sf’ ...
** package ‘sf’ successfully unpacked and MD5 sums checked
configure: CC: clang
configure: CXX: clang++
checking for gdal-config... no
no
configure: error: gdal-config not found or not executable.
ERROR: configuration failed for package ‘sf’
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/sf’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘sf’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
    ‘/private/var/folders/1m/w_zt5ygd26n_87h41qf574wc0000gn/T/RtmpNlYbwT/downloaded_packages’

为什么下载失败，但是显示源代码包已经下载完成？这是怎么回事？

- invictus

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首先，它并没有说下载失败，而是安装失败。此外，GDAL是一个用于地理空间矢量操作的C++库，并带有一组R绑定。看起来您需要使用您选择的软件包管理器安装GDAL，然后安装其R绑定，最后再安装这个sf包。 - Sebastian Lenartowicz

你使用的是Windows系统吗？我建议你先尝试安装二进制文件，因为我相信这将为你提供gdal。 - jsta

不，我在Mac上。无法通过brew安装gdal。不确定如何进行故障排除。 - invictus

截至2019年11月，“brew install gdal”可行，并解决了该问题。 - peak

Answer 1

面对类似的问题，我按照以下步骤进行了操作：

1. 在终端中输入gdalinfo --version命令检查您使用的GDAL版本。我的版本是GDAL 2.2.0，发布于2017/04/28，通过执行brew update和brew upgrade得到。
2. 从https://github.com/r-spatial/sf下载macOS版，并按照说明进行安装。由于我已经安装了GDAL，所以我只执行了brew unlink gdal然后执行brew link --force gdal2
3. 重新在R上安装rgdal：install.packages("rgdal", repos = "http://cran.us.r-project.org", type = "source") 确认编译时使用了configure: GDAL: 2.2.0
4. 最后，执行install.packages("sf") ，它需要被编译：binary source needs_compilation sf 0.5-3 TRUE
5. 再次确认configure: GDAL: 2.2.0 和 checking GDAL version >= 2.0.0... yes

之后，我成功安装了新版本：library(sf) Linking to GEOS 3.6.2, GDAL 2.2.0, proj.4 4.9.3

希望这也能为您提供解决方案。

- RgrNormand

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rgdal::getGDALVersionInfo(str = "--version") 可以让你确定在 rgdal 中使用的 GDAL 版本。 - Elin

Answer 2

sf的GitHub页面提供了安装说明，其中包括一些关于此问题的信息。除了按照那里的步骤使用brew安装gdal之外，我还必须单独安装proj：

https://github.com/r-spatial/sf

- mdg

Answer 3

实际上，一个简单的解决方法是从CRAN下载sf文件，然后手动安装它。

我遇到了同样的问题，并使用这种方法解决了它。

- Mingze Li