作为研究生，我的工作是捕捉显微镜图像并使用Python将它们保存为原始的tif格式。我想添加元数据，例如我所使用的显微镜名称、放大倍数和成像激光波长等信息。这些详细信息对于我后处理图像非常重要。
我应该可以在tif文件中添加这些信息，对吗？因为它有一个头文件？
我已经成功地在一个PIL图像中添加了附加信息：
im.info['microscope'] = 'george'
但是，当我保存并加载该图像时，我添加的信息就消失了。
我愿意听取任何建议。如果必要的话，我会保存一个带有元数据的单独的 .txt 文件，但将其嵌入图像中会更好。
Tifffile 是在 Python 中保存带有大量元数据的显微图像的一种选择。
它没有很多外部文档，但是 docstings 很好，所以您可以通过在 Python 中键入 help(tifffile) 或查看源代码来获取很多信息。
您可以在源代码（第750行）中查看 TiffWriter.save 函数，以获取可用于编写元数据的不同关键字参数。
其中一个选项是使用 description，它接受一个字符串。当您读取图像时，它将显示为标签 "ImageDescription"。
另一个选项是使用 extratags 参数，它接受一个元组列表。这允许您编写任何存在于TIFF.TAGS()中的标记名称。最简单的方法之一是将它们编写为字符串，因为那样就不必指定长度。
您还可以使用 ijmetadata 编写 ImageJ 元数据，其可接受的类型在此处列出。
例如，如果您编写以下内容：
import json
import numpy as np
import tifffile
im = np.random.randint(0, 255, size=(150, 100), dtype=np.uint8)
# Description
description = "This is my description"
# Extratags
metadata_tag = json.dumps({"ChannelIndex": 1, "Slice": 5})
extra_tags = [("MicroManagerMetadata", 's', 0, metadata_tag, True),
("ProcessingSoftware", 's', 0, "my_spaghetti_code", True)]
# ImageJ metadata. 'Info' tag needs to be a string
ijinfo = {"InitialPositionList": [{"Label": "Pos1"}, {"Label": "Pos3"}]}
ijmetadata = {"Info": json.dumps(ijinfo)}
# Write file
tifffile.imsave(
save_name,
im,
ijmetadata=ijmetadata,
description=description,
extratags=extra_tags,
)
阅读图片时，您可以看到以下标签：
frames = tifffile.TiffFile(save_name)
page = frames.pages[0]
print(page.tags["ImageDescription"].value)
输出：'这是我的描述'
print(page.tags["MicroManagerMetadata"].value)
输出结果: {'ChannelIndex': 1, 'Slice': 5}
print(page.tags["ProcessingSoftware"].value)
输出：我的面条式代码
from __future__ import print_function, unicode_literals
import json
import numpy
import tifffile # http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/code/tifffile.py.html
data = numpy.arange(256).reshape((16, 16)).astype('u1')
metadata = dict(microscope='george', shape=data.shape, dtype=data.dtype.str)
print(data.shape, data.dtype, metadata['microscope'])
metadata = json.dumps(metadata)
tifffile.imsave('microscope.tif', data, description=metadata)
with tifffile.TiffFile('microscope.tif') as tif:
data = tif.asarray()
metadata = tif[0].image_description
metadata = json.loads(metadata.decode('utf-8'))
print(data.shape, data.dtype, metadata['microscope'])
首先，Image.info 并不适用于任意的额外数据。在保存时，它通常会被忽略。
如果您查看 TIFF 的 PIL 文档，您将看到它将附加数据读入到一个特殊属性 Image.tag 中，并可以通过向 Image.save 方法传递 tiffinfo 关键字参数来保存数据。但是，这些附加数据是从 TIFF 标签 ID 映射到二进制数据块的映射。您可以从未记录的 PIL.ExifTags.TAGS 字典（或自己在线查找）中获取 Exif 标签 ID，但这就是 PIL 将为您提供的全部支持。
tag和首先使用tiffinfo需要一个相当新的Pillow版本；旧版本和经典PIL不支持它。（具有讽刺意味的是，它们对JPG文件具有部分EXIF支持，但从未完成并已被剥离...）此外，尽管似乎没有记录，如果您构建了没有libtiff的Pillow，则似乎会忽略tiffinfo。GExiv2或pyexif进行EXIF。）