在Jupyter iPython中运行Cython

Question

使用Cython接口在时间试验中运行几何级数的迭代循环。

在编译时出现错误（shift-enter）：CompileError：命令“gcc”以1的退出状态失败

%load_ext Cython

%%cython
def geo_prog_cython(double alpha, int n):
    cdef double current = 1.0
    cdef double sum = current
    cdef int i
    for i in range(n):
        current = current * alpha
        sum = sum + current
    return sum

错误：

//anaconda/lib/python3.5/distutils/command/build_ext.py in build_extension(self, ext)
    530                                          debug=self.debug,
    531                                          extra_postargs=extra_args,
--> 532                                          depends=ext.depends)
    533 
    534         # XXX outdated variable, kept here in case third-part code

- rrg

---

没有看到任何错误。请粘贴完整的错误报告。 - hruske

DistutilsExecError
//anaconda/lib/python3.5/distutils/spawn.py in _spawn_posix(cmd, search_path, verbose, dry_run) 158 "命令 %r 执行失败，退出状态码为 %d" --> 159 % (cmd, exit_status)) 160 elif os.WIFSTOPPED(status):DistutilsExecError: 命令 'gcc' 执行失败，退出状态码为 1 - rrg

请您能否粘贴完整的回溯信息，而不仅仅是错误信息。 - hruske

你尝试过在Jupyter以外的环境中使用Cython吗？我认为这可能是你的Cython配置出了问题。 - Tadhg McDonald-Jensen

有什么提示可以告诉我们什么是正确的Cython设置吗？ - rrg

Answer 1

我知道这个问题很旧，但我认为这可能对某些人有所帮助。

我在使用旧版 Py2.7 项目时遇到了这个问题，而且是在 Windows 上。

如果你正在 Windows 上使用 Py2.7，请检查你是否安装了适用于 Python 的 MS Visual Studio C++ 编译器 (下载链接)。不确定 Py3 需要做哪些更改。

对于你的 Anaconda 环境，请找到 Lib\distutils 目录并创建一个 distutils.cfg 文件（如果还没有，请根据需要修改当前文件）。

你需要让构建配置看起来像下面这样:

[build]
compiler=msvc

如果在 Linux 上，请确保你有必要的 devel 包可用，例如：

Ubuntu： apt-get install python-devel

- ConnectedSystems

Answer 2

我使用Anaconda3能够在没有错误的情况下重现此问题：

%load_ext Cython
%%cython -a

def geo_prog_cython(double alpha, int n):
    cdef double current = 1.0
    cdef double sum = current
    cdef int i
    for i in range(n):
        current = current * alpha
        sum = sum + current
    return sum

例子：

geo_prog_cython(0.5, 5)
1.96875

代码看起来没问题。可能是你的设置出了问题。

- Kamil Sindi