错误设置证书验证位置，安装_install_github

Question

我正在尝试从Github安装一个软件包，但是当我使用install_github时，一直报错。

library(devtools)
install_github(repo="swirl", username="ncarchedi")
在下载来自https://github.com/ncarchedi/swirl/archive/master.zip的swirl.zip时发生错误
在function (type, msg, asError = TRUE)中出现错误: 
无法设置证书校验位置:
CAfile:/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.0/Resources/library/RCurl/CurlSSL/cacert.pem
CApath:none

我已经尝试安装了几个不同的软件包（包括更新版本的ggmap），但总是出现相同的错误。这必定与RCurl有关，但是我不明白问题出在哪里，也不知道如何解决。我的devtools（Version 1.3）和RCurl（Version 1.95-4.1）都很新。我正在运行Mac上的R version 3.0.1 ("Good Sport")。

sessionInfo()的结果：

sessionInfo()
R version 3.0.1 (2013-05-16)
Platform: x86_64-apple-darwin10.8.0 (64-bit)

locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8
attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base 
other attached packages:
[1] RCurl_1.95-4.1 bitops_1.0-5   devtools_1.3  

loaded via a namespace (and not attached):
[1] digest_0.6.3   evaluate_0.4.3 httr_0.2       memoise_0.1    parallel_3.0.1  stringr_0.6.2 
[7] tools_3.0.1    whisker_0.3-2

- Sarah Supp

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看起来是RCurl的问题。这个文件实际上存在吗：/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.0/Resources/library/RCurl/CurlSSL/cacert.pem？ - Thomas

嗯，在我的Mac 10.8.5上可以运行。安装rCharts的这条评论可能会有用 https://github.com/ramnathv/rCharts/issues/135#issuecomment-20140615 - sckott

是的，就像@Thomas所说的那样，你是否已经安装了libcurl？尝试在命令行上查找curl-config以查看是否已安装，如果没有，请按照此处的说明进行安装http://www.omegahat.org/RCurl/FAQ.html。虽然也许你无法在没有安装curl的情况下安装RCurl... - sckott

是的，我已经安装了RCurl，并且正好在你提到的位置（/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.0/Resources/library/RCurl/CurlSSL/cacert.pem）。目录中有3个文件：boost.pem、ca-bundle.crt和cacert.pem。 - Sarah Supp

这个建议尝试重新安装RCurl http://stackoverflow.com/a/16547624/1091766 - 尝试重新安装RCurl - sckott

Answer 1

问题是由于R软件包curl的更改引起的。

您可以按照以下步骤解决问题：

1). 打开新的MRO会话并删除curl和httr软件包：

remove.packages(c("curl","httr"))

2). 重新启动MRO并再次使用install.packages()函数安装软件包：

install.packages(c("curl", "httr"))

3). 设置环境变量 CURL_CA_BUNDLE：

Sys.setenv(CURL_CA_BUNDLE="/utils/microsoft-r-open-3.4.3/lib64/R/lib/microsoft-r-cacert.pem")

4). 尝试使用install_github()从github安装软件包（现在应该可以正常工作）：

例如：

install_github("ropensci/tokenizer")

参考资料：

rvest的read_html函数无法正常工作

- Fan Yang

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在Ubuntu 18.04服务器上，我必须先安装libcurl4-openssl-dev才能安装curl。然后运行Sys.setenv(CURL_CA_BUNDLE="/opt/microsoft/ropen/3.5.1/lib64/R/lib/microsoft-r-cacert.pem")。 - rinzy kutex

Answer 2

这个与之类似的问题的SO回答建议尝试重新安装RCurl，这可能会修复您机器上curl的路径（我猜测），无论如何，请尝试。

- sckott

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我无法使用这个解决方案修复。 - Shixiang Wang

Answer 3

我在向 Github 推送更改时遇到了这个错误：
git config --global http.sslverify "false" 可以解决这个问题。

这里有原始讨论的链接：
https://github.com/npm/npm/issues/1484

- Lokesh Tiwari

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它可以工作，但跳过 SSL 验证不是一个好的做法。 - Tito