如何在emacs-ess中从R语言访问bash环境变量

Question

在我的 .bashrc 文件中，我有这样一行代码：

export SETTINGS=/home/user/settings.xml

如果我在bash中加载R，我可以使用Sys.getenv函数访问此变量：

Sys.getenv("SETTINGS")
"/home/user/settings.xml"

如果我在Emacs中打开R(M-x R)，SETTINGS是空的：

Sys.getenv("SETTINGS")
""

我尝试过以下方法：

1. adding the following to .emacs, based on How do I make Emacs recognize bash environment variables for compilation?

   ;; get environment vars from .bashrc
   (let ((path (shell-command-to-string ". ~/.bashrc; echo -n $SETTINGS")))
     (setenv "SETTINGS" path))
   

2. opening up bash in emacs using M-x term

   echo $SETTINGS         # works
   R
   Sys.getenv("SETTINGS") #works
   

3. If I open emacs from the terminal, the SETTINGS variable is available as expected. Opening emacs from the Applications menu (with either the command /usr/bin/emacs23 %F or emacs) does not work.

4. comparing output from session("env") when loading R in bash vs emacs, but nothing stands out other than (bash = <, emacs = >):

   > INSIDE_EMACS=23.3.1,comint
   6d5
   < SETTINGS=/home/user/settings.xml
   9c8
   < SHLVL=1
   > SHLVL=0
   14a14
   > PAGER=cat
   16d15
   < PAGER=/usr/bin/pager
   19d17
   < COLORTERM=gnome-terminal
   25c23
   < WINDOWID=14680069
   > DESKTOP_AUTOSTART_ID=1020ce948b944a88113395253627645060000001863000
   < TERM=xterm
   > TERM=dumb
   

我可以在emacs-ess中从R中访问SETTINGS吗？

1. 或者，我可以将设置导出到我可以访问的某个地方吗？

- Abe

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你是如何启动Emacs的？如果你在bash shell中启动（带有环境变量设置），并从那里启动Emacs，它应该可以工作。目前看来，父进程没有这个环境变量（从Gnome shell或类似的地方启动）。 - Matthew Lundberg

@MatthewLundberg 我更新了我的答案（请参阅第3点）。从终端打开有效。从应用程序菜单、Gnome-do或键盘快捷方式调用 /usr/bin/emacs23 %F 打开无效。 - Abe

Answer 1

我不知道R和自定义环境变量，但我已经在emacs中将PATH变量设置为与我的bashrc中相同的值。我修改了我的代码以解决你的问题，请试用并告诉我是否有效。

;; set env variable in Emacs
(getenv "SETTINGS")
(setenv "SETTINGS" "/home/user/settings.xml")

原始代码（用于PATH）是：

;; Emacs has its own path variable
(getenv "PATH")
 (setenv "PATH"
(concat
 "/usr/local/texlive/2011/bin/x86_64-linux" ":"
(getenv "PATH")))

- elemakil

Answer 2

当启动xsession时，可能不会读取.bashrc文件。可以尝试添加以下内容：

export SETTINGS=/home/user/settings.xml

在启动X会话时，可以在.xsessionrc或.gnomerc（如果您使用gnome）中设置。这些文件会在启动时加载。

- Rémi

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它们可能比xsessionrc更好，因为它们在通过ssh登录时被读取。 - Rémi

Answer 3

如果您在emacs中启动R会话，则R会话将具有与emacs相同的环境变量。因此，您应该首先确保以这种方式启动emacs，使其环境包含您的SETTINGS变量。这样，您在emacs内部启动的R会话也将在其环境中具有SETTINGS。如何实现这一点取决于您的系统。

- ALiX

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我的系统是Ubuntu和RedHat；你有什么进一步的建议吗？我如何在emacs中查看环境？如果我使用M-x term在emacs中打开一个bash终端，变量是存在的。 - Abe

Answer 4

你可以放置

SETTINGS <- "/home/user/settings.xml"

在.Rprofile中作为解决方法。

- Jason Morgan

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那将是一个合适的解决方法，除非我希望能够在“R --vanilla”模式下访问该变量。 - Abe