knitR/RMD：选择输出文件夹

Question

我将使用RMD文件来创建软件包说明。我的RMD文件存储在

 .../path_to_package/vignettes/vignette.rmd

在创建PDF时，在R Markdown控制台窗口中的最后一行是“输出已创建：/tmp/...”。有什么办法可以直接在vignettes文件夹中创建PDF而不是在/tmp/..文件夹中创建吗？我正在使用Ubuntu 14.04 LTS和R 3.3.0，rmarkdown 0.9.6和knitr 1.13。祝好，约翰尼斯。

- J_F

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我不确定我理解这个问题，难道通常的行为不是将PDF输出到存储RMD文件的同一文件夹中吗？这不是你所发生的情况吗？ - user5359531

不，对我来说不是这样的。 - J_F

我认为这与此前的问题有关。看起来最直接的选项是设置opts_knit（如上面的链接）或者在这个潜在的解决方法中。还有其他人分享了你的痛苦或类似的情况。 - Tad Dallas

谢谢提供的链接。我现在意识到，当使用render（“/path_to_my_file.Rmd”）时，输出文件夹与输入*.Rmd文件相同。 但是，在RStudio中使用KnitPDF按钮时，文件存储在“/tmp/…”中。 - J_F

Answer 1

rmarkdown::render 默认情况下确实会将输出放在与输入文件夹相同的目录中，但是您可以通过向其提供一个 output_dir 参数（如果需要指定不同的文件名，也可以提供一个 output_file 参数）来覆盖该设置。

我不确定为什么 RStudio 中的 Knit 按钮对您来说会有所不同——在我的情况下，它也会将输出放在与源文件夹相同的位置（即使我没有指定工作文件夹，我的主目录仍然是默认值），并且当您单击该按钮时，RStudio 不会显示它正在调用的函数，因此可能有点难以确定。我建议现在使用带有 指定参数 的 rmarkdown::render()。

- jimjamslam

Answer 2

请使用

devtools::build_vignettes()

它会自动将文件放在它们应该去的地方。还要看看 Hadley Wickham 的 指南。它非常棒！

- Felipe Gerard