在RStudio中通过Rprofile.site加载dplyr

Question

自从我发现它，我就一直在虔诚地使用dplyr。因为我使用得如此频繁，我尝试将library(dplyr)放入我的Rprofile的.First()函数中。

这样会加载dplyr，但当我启动Rstudio时，一些dplyr的函数被掩盖了。例如，当我尝试执行以下操作时：

foo <- mtcars %>% filter( cyl == 4 )

我遇到了如下错误：

Error in filter(mtcars, cyl == 4) : object 'cyl' not found

一些故障排除揭示出，如果我在控制台再次运行library（dplyr），问题就会迎刃而解——显然，dplyr的某个/某些函数被一些更深入搜索路径的东西所掩盖（或者更高，这取决于你怎么看它）。

当我查看我的搜索()路径时，我发现有许多其他包在dplyr之后加载，这并不是我想要的（我希望dplyr是最后一个被加载的东西，或者至少几乎是最后一个）。

[1] ".GlobalEnv"        "tools:rstudio"     "package:stats"     "package:graphics"  "package:grDevices" "package:utils"    
[7] "package:datasets"  "package:xlsx"      "package:xlsxjars"  "package:rJava"     "package:dplyr"     "package:methods"  
[13] "Autoloads"         "package:base" 

我正在使用Windows 7操作系统，使用的是RStudio v.0.98.1028版本。由于我不太清楚Windows + RStudio如何处理主目录，因此我正在编辑C:/Program Files/R/R-3.1.1/etc/中的Rprofile文件。有什么建议吗？

- crazybilly

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如果您不将其放入“.First”函数中会发生什么？也就是说，如果您只是将其裸露地放入“.Rprofile.site”文件中呢？ - Richie Cotton

很不幸，我仍然得到相同的错误，并且search()顺序仍然是一样的。 - crazybilly

就我个人而言，我认为将包放在.Rprofile文件中是一个不好的主意，因为它会使得代码难以复现。 - hadley

长期跟进这个问题，我遵循@hadley的建议，创建了一个Rstudio片段，写入几行代码以加载我经常使用的所有库。现在，我只需键入“prep”，然后按Tab键几次，再按ctrl + shift + s，就可以加载所有库，而且当我稍后返回脚本时，一切都能正确加载。 - crazybilly

Answer 1

在R的启动顺序中（参见?Startup），在加载其他软件包之前，将首先调用.First()函数，其后再调用.First.sys()函数。覆盖filter的是stats软件包。

为了确定要加载哪些软件包，.First.sys()使用options("defaultPackages")。因此，建议您在.First()函数中编辑该选项，具体方法如下：

options(defaultPackages=c(getOption("defaultPackages"),"dplyr"))

- James

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啊，成功了！我需要改变的唯一一件事是 options('defaultPackages') 是一个列表——你之前添加了 dplyr 作为新的列表项。为了将 dplyr 加入到向量本身中，我必须使用： options(defaultPackages=c(options("defaultPackages")[[1]],"dplyr"))谢谢！ - crazybilly