“fread”与前导/尾随空格不兼容？

Question

我将尝试在R中读取一个由空格分隔的列的文本文件。我尝试使用data.table，因为read.csv读取时间太长。然而，第一列有前导空格，在fread()中出现以下错误。
“测试标题行格式后未正确定位。ch=' '”

数据格式类似于：

    45 36 46  
    45 67 35

有没有办法使用fread()读取该文本文件而不需要重新格式化它？

- DonDyck

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有标题行吗？你能给出文件的前几行吗？ - MrFlick

没有标题行。 - DonDyck

Answer 1

这是一个使用 readLines 的解决方案，但我不确定速度如何。

require(data.table)

setwd("~")

in.df <- data.table(A = c(" a1"," b2"," c3"," d4"),
                    B = c(11,22,33,44))
in.df

write.table(in.df, file="testing.dat", quote = F,
            row.names = F, col.names = F)

dat <- paste(sub("^\\s+", "", readLines("testing.dat")), collapse = "\n")
dat

test.df <- fread(dat, stringsAsFactors = F)
test.df

- djhurio

Answer 2

如果您使用的是Linux系统，请尝试使用fread("sed 's/^[[:blank:]]*//' testing.dat")命令。该sed命令将删除testing.dat文件中每行开头的空格。

- cogitovita