在R脚本中解析命令行参数

Question

在R脚本中解析命令行参数

parsingrcommand-line-arguments

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有没有方便的方法可以自动解析传递给R脚本的命令行参数？

类似于perl中的Getopt::Long？

- David B

与https://dev59.com/z3I95IYBdhLWcg3wyRI0相关。 - Blaisorblade

5个回答

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最简单的方法是使用commandArgs()函数。示例代码如下，将其保存为“options.R”：

options <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)
options

使用“Rscript options.R x y z”运行。结果：

[1] "x" "y" "z"

i.e. 一个包含3个元素的列表，每个元素对应一个参数。

- neilfws

7

这与 getopt 的选项解析不相似。 - Alex Reynolds

4

请注意，我在将近7年前回答了这个问题；现在肯定有更好的方法 :) - neilfws

12

仅仅作为对Rscript答案的补充：

edd@max:~$ r -e 'print(argv)' flim flam flom
[1] "flim" "flam" "flom"
edd@max:~$

在 littler 中，我们只是使用 argv。我使用 getopt 好几次了，这是两个可用解析包中较旧的一个。

- Dirk Eddelbuettel

6

我可以介绍一下Xmisc包中的ArgumentParser。它是一个命令行解析器，受到Python的argparse启发，但它不需要使用Python。

您可以查看此链接以获取更多信息：http://cran.r-project.org/web/packages/Xmisc/vignettes/Xmisc-ArgumentParser.pdf

以下是相关截图：

- xb.

1

getopt long 是按照 --parameter=argument 的格式进行的。

rscript script.R --parameter1=argument1 --parameter2=argument2

可以仅使用基本字符串包进行解析。

示例

`cli.r`

library(pracma)
library(stringr)
run.arguments <- commandArgs(TRUE)
valid.run.parameters <- c( "universe", "character", "ability" )
for ( i in 1:length( run.arguments ) ) {
    if ( strcmpi( substr( run.arguments[i], 1, 2 ), "--" ) & grepl( "=", run.arguments[i], fixed = TRUE) ) {
        key.pair <- str_split( run.arguments[i], "=", simplify=TRUE )
        run.parameter <- gsub( "--", "", key.pair[1] )
        run.argument <- key.pair[2]
        if ( run.parameter %in% valid.run.parameters ) {

            # DO YOUR MAGIC HERE! Here is an example...
            cat( run.parameter, "\n" )
            cat( run.argument,  "\n\n" )

        }
    }
}

上述脚本是为了简洁而编写的。请查看更具吸引力的版本。

用法

rscript cli.R --universe=MCU --character="Wade Wilson"

输出

universe
MCU

character
Wade Wilson

- Abel Callejo

网页内容由stack overflow 提供, 点击上面的

可以查看英文原文，
原文链接

- rcs · Accepted Answer

在CRAN上有三个包：

getopt: C语言 getopt 命令行选项解析行为
optparse: 受 Python 的 optparse 库启发的命令行解析器
argparse: 基于 Python 的 argparse 库实现的可选和位置参数解析器。该包需要安装带有 argparse 和 json（或 simplejson）模块的 Python 解释器。

更新：

docopt：只需按照特定格式提供描述信息，即可定义命令行接口。这是一个 docopt.py 的端口。
argparser: 使用纯 R 编写的跨平台命令行参数解析器，不依赖任何外部组件。这个包在 Rscript前端下很有用，可以将 R 脚本转换为可执行脚本。
minimist: 与 minimist JavaScript 库绑定。该模块实现了 optimist 的参数解析器的核心功能，但没有所有花哨的装饰（没有外部依赖）。
optigrab: 使用简单、干净的语法从命令行分析选项。它几乎不需要或者完全不需要指定，并支持短选项和长选项，GNU、Java 或 Microsoft 样式的语法，动词命令等等。