在每一行的开头添加字符串

Question

我有兴趣在每行的列的开头添加一个字符串 chr。

该文件是以制表符分隔的，大致如下：

re1 1   AGT
re2 1   AGT
re3 2   ACGTCA
re12    3   ACGTACT

我需要的是：

re1 chr1    AGT
re2 chr1    AGT
re3 chr2    ACGTCA
re12    chr3    ACGTACT

解决方案可以是一个简洁的Bash命令行代码。

- Irek

Answer 1

这个怎么样？

$ awk '$2="chr"$2' file
re1 chr1 AGT
re2 chr1 AGT
re3 chr2 ACGTCA
re12 chr3 ACGTACT

解释

使用$2="chr"$2，我们将chr添加到第二个字段中。然后我们不需要任何其他命令来获得所需的输出，因为awk的默认行为是print $0。

为了确保输出字段分隔符（OFS）为制表符，您可以执行以下操作：

$ awk 'BEGIN{OFS="\t"}$2="chr"$2' file
re1     chr1    AGT
re2     chr1    AGT
re3     chr2    ACGTCA
re12    chr3    ACGTACT

- fedorqui

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很高兴它对你起作用了，@Irek！记得如果你的问题已经解决，可以将其中一个答案标记为已接受。问候 - fedorqui

Answer 2

Awk一行命令是什么？

$ awk -v OFS=$'\t' '{ $2="chr" $2; print}' so.txt
re1     chr1    AGT
re2     chr1    AGT
re3     chr2    ACGTCA
re12    chr3    ACGTACT

- MattH

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如何在第一列之后的每一列都执行此操作？如果每行的列数不同，代码会改变吗？ - Sky Scraper

Answer 3

sed 一行命令：

sed 's/\<[0-9]\>/chr&/' < input > output

- mohit