Graphviz DOT如何将节点排列成圆形，布局太过“紧凑”？

Question

我已经做了一半，请查看编辑部分

好的，这是我的问题：我正在生成一个Python模块的图表，包括所有文件及其函数/方法/类。

我希望将节点围绕其父节点分组成圆圈，目前所有内容都在一个巨大的水平行上，使整个图表超过50k像素宽，并且svg转换器失败（仅呈现约一半的图表）。

我查看了文档，但找不到任何似乎能解决问题的东西。

所以问题是：
有没有简单的方法来实现这一点，还是我必须自己布局整个图表？ :/

编辑：
由于Andrews的评论，我得到了正确的布局，唯一的问题现在是它有点“紧凑”...那么现在的问题是，如何解决这个问题？

- Ivo Wetzel

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你尝试使用过"neato"布局吗？它可能会得到你想要的结果。 - Andrew

刚刚尝试了一下通过命令行开关-K，有点可行，见我的编辑。 - Ivo Wetzel

有点晚了，但如果您遇到了重叠的布局问题，只需设置"overlap=false"即可解决。 - pablasso

Answer 1

layout slightly: use a lighter color scheme, eg, node_A [color=lightblue]; this will reduce the visual weight of your graph and make it appear less cluttered.

我已经提到了影响您当前布局的所有最重要参数，并为这些参数建议了值。但我认为只需应用其中几个建议即可获得所需的布局。

• 减小边缘权重，例如 [weight=0.5]；这将使得边变长，导致您目前在图表中看到的紧密聚集的集群“扩散”。

• 去掉节点边框，node_A [color=none; shape=plaintext]; 特别是对于椭圆形节点，节点的总空间中有大量“未使用”的部分（即未用于显示节点标签）。

• 明确定义节点的字体大小（节点边框被放大以包围节点文本，这意味着给定节点的字体大小和文本量对其大小有重要影响）；[fontsize=11] 应足够大且可读，同时还可以减少“混乱”的外观（默认大小为14）。

• 通过“nodesep”增加节点之间的最小距离；例如，nodesep=2.0；这将直接解决您对图表“过于紧凑”的反对意见。（在节点、边缘或图形的所有参数中，“nodesep”和“ranksep”可能会对dot绘制图形产生最大影响。在您的情况下，看起来您只有两个节点等级；“ranksep”设置不同等级节点之间的最小距离——看起来组成您的图表的所有节点都处于同一等级（除了中心的少数顶级节点）。

• 明确定义整个图的大小，例如 size="7.75,10.25"（确保您的图适合8.5 x 11页面并占据整个空间）

• 还有一个纯美学建议，最多只能稍微帮助您的布局：使用较浅的颜色方案，例如 node_A [color=lightblue]；这将减轻您的图表视觉负担，并使其看起来不那么杂乱。

图形显得不那么混乱：默认的边缘和节点字体颜色都是黑色。图形上大部分的墨水都来自这两种结构（特别是如果您删除节点边框），因此我建议将节点（文本）字体颜色或边缘字体颜色设置为“蓝色”以帮助眼睛区分这两组图形结构。

- doug

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事实上，我在这里报告了一个非常类似的问题，使用 ranksep 是扇形图的关键配置。谢谢！ - Bruno Penteado

你可以帮我找一下相关的文档吗？还有工作代码示例吗？ - Jesvin Jose

Answer 2

如果图形过于紧凑，您需要调整边缘长度。根据图形布局，您有几个选项：

1. 如果您的布局是sfdp或fdp，请调整K属性。默认值为0.3。
2. 对于neato（或fdp），请调整len属性。neato的默认值为1.0，fdp的默认值为0.3。
3. 对于dot，您可以使用minlen属性来定义最小边长。默认值为1。

您还可以尝试调整图形属性model以确定聚类行为。具体来说，请尝试subset。我相信这会为您处理len：http://www.graphviz.org/doc/info/attrs.html#d:model 此外，您可以使用缩放技术完全消除重叠：http://www.graphviz.org/doc/info/attrs.html#d:overlap。

- spenthil

Answer 3

我有大约500个节点，并使用了Doug的建议。

这是我的示例代码（使用Python）：

f = Digraph('companies',filename='companies.gv',
          edge_attr={'weight':'1',
                     'fontsize':'11',
                     'fontcolor':'blue',
                     'len':'4'},
          graph_attr={'fixedsize':'false', 
                      'bgcolor':'transparent'},
          node_attr={'fontsize':'11', 
                     'shape':'plaintext', 
                     'color':'none',
                     'fontcolor':'black'})

f.attr(layout="neato")
f.attr(nodesep='3')
f.attr(ranksep='3')
f.attr(size='5000,5000')

- Resu