R数据表中使用fwrite转换为fread时使用空格分隔符和空值的处理

Question

R数据表中使用fwrite转换为fread时使用空格分隔符和空值的处理

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我在使用fread函数时遇到了问题，主要是针对空格作为分隔符且会有连续的空值情况。例如：

dt <- data.table(1:5,1:5,1:5) #make a simple table
dt[3,"V2" := NA] #add a blank in the middle to illustrate the problem
fwrite(dt, file = "dt.csv", sep = " ") #save to file
dt <- fread("dt.csv", sep = " ") #try to retrieve

fread出现错误："第4行提前停止。期望3个字段，但只找到了2个。" 问题似乎在于中间列中有NA值，fwrite将给出value|space|space|value的结果，然后fread无法识别中间的隐含空白值。

我知道一开始使用另一个分隔符可能更简单。但是，有没有可能让fread还原原始数据表？ 带读取侧解决方案的编辑： 我在这里找到了相同的问题here。虽然它提供了一个解决方案，但后来却出现了问题。在追寻其他线索时，我现在发现使用类似Unix命令的fread()的最接近的读取侧解决方案是：

dt <- fread(cmd="wsl sed -r 's/ /,/g' dt.csv") #converts spaces to commas on the way in

在Windows 10系统上，我不得不进行一些尝试和错误才能运行Unix命令。 "wsl" 部分似乎取决于系统。这个视频很有帮助，我使用了他在那里描述的第一种方法。这个问题和这个问题提供了更多关于使用fread和sed的信息。后者说sed随rTools而来，但我没有尝试过。

- Mark E.

展示样本文本文件的原始内容（在代码块中）可能更有效，而不是试图以编程方式创建它。虽然我赞赏这种努力，但最终，在这里写作并不重要，过度努力这样做可能会分散注意力。（这还可以让您更恰当地模仿您尝试导入的实际文本文件。） - r2evans

@r2evans 谢谢，我会考虑一下。在这个简单的情况下，我认为有趣的是fwrite输出的内容，fread会误解。 - Mark E.

1个回答

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可以查看英文原文，
原文链接

- Billy34 · Accepted Answer

也许默认情况下将 NA 导出为其他内容而不是 ""。

这里我使用 @。

library(data.table)
dt <- data.table(1:5,1:5,1:5) #make a simple table
dt[3,"V2" := NA] #add a blank in the middle to illustrate the problem
fwrite(dt, file = "dt.csv", sep = " ", na="@") #save to file
dt <- fread("dt.csv", sep = " ",na.strings = "@") #try to retrieve