MongoDB 数据库集合损坏？

Question

MongoDB 数据库集合损坏？

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我有一个分片的Mongo 2.4.3设置。

当我尝试在我的某个集合上运行查询时，会收到错误消息exception: BSONObj size: 0 (0x00000000) is invalid. Size must be between 0 and 16793600(16MB) First element: EOO

我已经运行了db.repairDatabase，但似乎没有什么帮助。

当我只做 db.collection.findOne() 时，运行正常，但是当我例如进行 db.collection.find({'_id': {'$gte': ObjectId("52631d000000000000000000")}} 这样的操作时，就会出现上述错误。

我已经读到这可能是由于损坏的索引导致的，所以我尝试过：

db.collection.reIndex();
{
    "raw" : {
        "rs0/ec2-xx-xxx-xxx-xxx.us-west-2.compute.amazonaws.com:27017,ec2-xx-xxx-xxx-xxx.us-west-2.compute.amazonaws.com:27017,ec2-xx-xx-xxx-xx.us-west-2.compute.amazonaws.com:27017" : {
            "nIndexesWas" : 2,
            "errmsg" : "exception: BSONObj size: 0 (0x00000000) is invalid. Size must be between 0 and 16793600(16MB) First element: EOO",
            "code" : 10334,
            "ok" : 0
        }
    },
    "ok" : 0,
    "errmsg" : "{ rs0/ec2-xx-xxx-xxx-xxx.us-west-2.compute.amazonaws.com:27017,ec2-xx-xxx-xxx-xxx.us-west-2.compute.amazonaws.com:27017,ec2-xx-xxx-xxx-xx.us-west-2.compute.amazonaws.com:27017: \"exception: BSONObj size: 0 (0x00000000) is invalid. Size must be between 0 and 16793600(16MB) First element: EOO\" }"
}

在执行此操作之前，我已删除了所有索引，仅保留了 _id 上的索引。

db.collection.getIndexes();
[
    {
        "v" : 1,
        "key" : {
            "_id" : 1
        },
        "ns" : "db.collection",
        "name" : "_id_"
    }
]

我还没有运气，而且我已经没有更多的想法了。有人有其他的建议吗？这个集合大约有9亿个文档，所以我真的需要恢复它。

- Pieter De Schepper

你试过先删除索引，而不是直接重新建立索引吗？ - Sammaye

唯一剩下的索引是在_id上的，它不能被删除，所有其他索引都已经被删除。 - Pieter De Schepper

我认为索引修复永远不会起作用。BSON 对象已经损坏，这是您的主要集合。我曾经遇到过同样的问题，但它可以正常工作。让我查看内部文档信息，看看我能否提供帮助。 - Maximiliano Rios

1个回答

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可以查看英文原文，
原文链接

- Adam Comerford · Accepted Answer

如果您已经成功运行了修复操作，那么您已经彻底重写了所有数据并重新构建了索引，因此您已经拥有一个全新的_id索引-实际上，您已经删除并重建了该索引。

您拥有一个副本集（rs0），那么如果您撤销当前的主节点会发生什么？-其他节点上的损坏是否也存在，还是只有一个？

如果只有一个（或至少有一个没有问题的节点），则清除带有损坏的实例并使它们重新同步，它将从其余“良好”节点中提取数据并消除损坏。这将是摆脱此类损坏的首选方法（远远超过其他方法），这是副本集的首要用途之一。

如果这不是一个选择，并且所有节点都显示相同的问题（这将很奇怪），那么您应该尝试执行以下操作：

使用--repair运行整个实例（即关闭mongod进程，然后重新启动），并让它从头开始重建所有数据（本地、所有数据库、所有索引）。
仅当且仅当这样做无法消除损坏时，最后的尝试方法是尝试mongodump --repair - 这种方法将尝试所有合理的方法来解决问题，并可能产生重复文档（取决于损坏的程度）。因此，您可能需要比mongod最初用于存储所使用的更多磁盘空间才能完成此操作。

最后，您应该升级到较新的MongoDB版本，特别是在分片环境中。截至撰写本答案时，当前版本为2.4.9，其中包含几个重要的错误修复 - 完整信息可以在mongodb-announce的发布公告中找到。