存储和访问节点属性 Python NetworkX

Question

存储和访问节点属性 Python NetworkX

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我用python的networkx创建了一个节点网络。我想要将信息存储在节点中，以便我可以基于节点标签（节点名称）和存储信息的字段（如节点属性）稍后访问该信息。存储的信息可以是字符串或数字。我希望以这样的方式进行操作，即如果xyz是一个节点:

那么我想要保存两个或三个具有字符串的字段，如xyz的出生日期dob=1185，xyz的出生地pob=usa和xyz的出生日dayob=monday。

我知道我可以使用G.add_node的属性字典字段...但是我似乎无法针对特定的字段进行访问。如果有其他方法，我会非常感激。

然后，我想要将xyz与网络中具有共同信息的其他节点进行比较。即基于出生日期、出生地和出生日的节点xyz与节点abc的交集。

例如，如果节点xyz和abc之间有一条边，则打印它们各自的dob，它们的pob和它们的dayob。

- user1295112

5个回答

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此外，您不必仅在添加节点时分配属性。即使在添加后，您仍然可以直接设置它们。

import networkx as nx
G=nx.Graph()
G.add_edge(1,2)
#see comment below code for recent versions of networkx.
G.nodes[1]['name'] = 'alpha'
G.nodes[2]['name'] = 'omega'

G.nodes[1]['name']
> 'alpha'

注意：在2.4版本之前，请使用G.node[]而不是G.nodes[]。请参见弃用说明。您还可以使用set_node_attributes(文档)，它将让您同时为多个节点设置属性。编辑

#use the next line if it's networkx version 1.x
#nx.set_node_attributes(G, 'cost', {1:3.5, 2:56})

#use the next line if it's networkx version 2.x
#nx.set_node_attributes(G, {1:3.5, 2:56}, 'cost')

#or for something that works for 1.x or 2.x
nx.set_node_attributes(G, values = {1:3.5, 2:56}, name='cost')

G.node[1]['cost']
> 3.5

类似的方法可以用于设置边属性。

- Joel

4

请注意，在networkx 2.x版本中，set_node_attributes()函数的第二个和第三个参数的顺序已经调换，所以应该这样写：nx.set_node_attributes(G, {1:3.5, 2:56}, 'cost')。 - Max Candocia

8

从 networkx v2.0 开始，你可以使用以下方法:

import networkx as nx

G = nx.Graph()
G.add_node('abc', dob=1185, pob='usa', dayob='monday')
nx.get_node_attributes(G, 'dob')
> {'abc': 1185}

您可以像往常一样访问此字典：

{'abc': 1185}['abc']
> 1185

- severinsimmler

5

显然现在

G.node[1]['name'] = 'alpha'

不再起作用。

我使用的是：https://networkx.github.io/documentation/stable/reference/classes/generated/networkx.Graph.nodes.html

在节点上添加一个s：

G.nodes[1]['name'] = 'alpha'

- Marine Galantin

3

注意：对于2.4版本之前的版本，请使用G.node[]而不是G.nodes[]。请参阅弃用说明（https://networkx.github.io/documentation/stable/release/release_2.4.html#deprecations）。 - Ben

0

要将属性添加为字典，您可以执行以下操作

g.add_node('node_id', **{"attr1": "val1", "attr2": "val2"})

小提示：如果你不添加**，就会出现异常：TypeError: add_node() takes 2 positional arguments but 3 were given

- Neil

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可以查看英文原文，
原文链接

- Maehler · Accepted Answer

就像你所说的那样，只需要在将节点添加到图形中时添加属性即可。

G.add_node('abc', dob=1185, pob='usa', dayob='monday')

或者作为字典

G.add_node('abc', {'dob': 1185, 'pob': 'usa', 'dayob': 'monday'})

要访问属性，就像访问任何字典一样访问它们即可

G.node['abc']['dob'] # 1185
G.node['abc']['pob'] # usa
G.node['abc']['dayob'] # monday

你说你想查看连接节点的属性。以下是一个小例子，演示如何实现。

for n1, n2 in G.edges_iter():
    print G.node[n1]['dob'], G.node[n2]['dob']
    print G.node[n1]['pob'], G.node[n2]['pob']
    # Etc.

从networkx 2.0开始，G.edges_iter()已被替换为G.edges()。节点也是如此。我们设定data=True来访问属性。代码现在是这样的：

for n1, n2 in list(G.edges(data=True)):
    print G.node[n1]['dob'], G.node[n2]['dob']
    print G.node[n1]['pob'], G.node[n2]['pob']
    # Etc.

注意：在 networkx 2.4 中，G.node[] 已被替换为 G.nodes[]。