在Jupyter中通过BASH脚本设置环境变量

Question

我试图在Jupyter笔记本中执行一个设置所需环境变量的BASH脚本。我知道魔术命令%env可以实现这一点，但在这种情况下需要使用BASH脚本。使用!source或%system都无法使环境变量在Jupyter笔记本中持久存在。是否有办法实现这个目标？

- user2153903

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我不太清楚你所说的“persist”是什么意思。你是指它们在重新启动后保持设置吗？还是指它们在不同的笔记本之间保持设置？或者是指它们在一个单元格到另一个单元格之间保持设置？请问你想要做什么？ - undefined

Answer 1

要永久设置变量(例如一个键), 你可以在IPython启动目录创建或编辑启动配置文件, 为你的 Jupyter 笔记本设置 Bash 环境变量.

cd ~/.ipython/profile_default/startup/
vim my_startup_file.py

该文件将在Jupyter启动时运行（请参阅同一目录中的README）。以下是启动.py文件应包含的内容：

  1 import os
  2 os.environ['AWS_ACCESS_KEY_ID']='insert_your_key_here'
  3 os.environ['AWS_SECRET_ACCESS_KEY']='another_key'

现在在Jupyter笔记本中，您可以调用这些环境变量，例如：

#Inside a Jupyter Notebook cell
import os
session = boto3.session.Session( 
    aws_access_key_id=os.getenv('AWS_ACCESS_KEY_ID'), 
    aws_secret_access_key=os.getenv('AWS_SECRET_ACCESS_KEY'),
    region_name='us-east-1'
) 

更改后，您需要重新启动内核才能使其生效。

- Proteinologist

Answer 2

你可以使用Python来更新操作系统变量：

Cell

! echo "export test1=\"This is the test 1\"" > test.sh
! echo "export test2=\"This is the test 2\"" >> test.sh
! cat test.sh

结果

export test1="This is the test 1"
export test2="This is the test 2"

单元格（取自在Python脚本中设置环境变量）

import os

with open('test.sh') as f:
    os.environ.update(
        line.replace('export ', '', 1).strip().split('=', 1) for line in f
        if 'export' in line
)

! echo $test1 
! echo $test2

结果

"This is the test 1"
"This is the test 2"

- J.M. Robles