如何从R中调用Rscript？

Question

我正在开发一个软件包，可以通过R接口（一堆可交互使用的函数）和Rscript命令行接口来使用。其中，通过一个小启动器来实现命令行接口，在命令行中输入：

Rscript mylauncher.R arg1 arg2 arg3

我希望调用我的包中的一个函数。 我想测试一些来自R的命令行。没什么花里胡哨的，只是确保一切都能正常运行而没有错误。 如果我在一个R源文件中测试这些调用:

system("Rscript mylauncher.R arg1 arg2 arg3")

如果有多个R安装（这实际上是我的情况），我该如何确保我调用了正确的R脚本？另一种方法是在R源文件中写入：

source("mylauncher.R")

但是我不知道如何指定命令行(我想避免覆盖函数commandArgs的技巧，因为我还想测试命令行的正确标记)。有人有想法吗？

谢谢！

- JavaNewbie

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你是否知道“你可以从R中调用R”？换句话说，当你已经在R中时，你为什么需要使用Rscript呢？ - Dirk Eddelbuettel

@DirkEddelbuettel 我认为我已经解释过了，“我想测试一下从R中运行几个命令行”，也就是说，我想测试一下在Unix终端中输入一些命令是否会导致错误，并且这个错误不是由于调用了错误版本的Rscript引起的。 - JavaNewbie

也许（在Unix系统上）可以使用 system("which Rscript")？ - Ben Bolker

Answer 1

关于如何确定我是否调用了正确的Rscript？如果有多个R安装怎么办？

您可以在命令行上查询R RHOME，并从R中查询Sys.getenv("R_HOME")。

然后，您需要附加bin/RScript，这样就可以得到与当前会话相对应的Rscript。我仍然设计我的库，以便可以从R中调用它们...

- Dirk Eddelbuettel