我使用了libSVM。它非常快速、简单,并且提供了一些有用的工具。这里有一些它的使用示例here。另一个好处是它还有C++和Java的实现,因此如果你需要在Matlab之外进行开发(例如将原型转化为更快的东西),你将拥有一个熟悉的接口进行工作。
这并没有直接回答你的问题,但如果你想加速一个M脚本,可以考虑使用嵌入式Matlab工具箱和MEX函数。基本上,你可以使用这些工具来编译你的M脚本,我已经尝试过了,至少可以获得一个数量级的性能提升。MW的人说你可以获得100倍的改进。