logo标签列表

致命错误: mpi.h文件不存在 #include <mpi.h>

c++cmpiopenmpi
61

当我只使用这个命令编译我的脚本时

#include <mpi.h>

它告诉我找不到该文件或目录，但当我把路径包含进mpi.h时

#include "/usr/include/mpi/mpi.h"

路径正确时返回：

In file included from /usr/include/mpi/mpi.h:2087:0,
                 from lbm.cc:7:
/usr/include/mpi/openmpi/ompi/mpi/cxx/mpicxx.h:35:17: fatal error: mpi.h: No such file or directory
 #include "mpi.h"
                 ^
compilation terminated.

有人知道如何修复这个问题吗？

你使用的编译器和操作系统是什么？ - muradin
g++在Linux上无法工作，而<mpi/mpi.h>也不起作用。 - user2804865
1
使用消息传递接口编写的程序应该使用类似于mpicc main.c -o main或者 mpiCC main.cpp -o main这样的命令进行编译。关于第二条信息：你的计算机上可能有两个MPI标准的实现。您可以通过键入which mpicc，which mpirun，mpirun --version或module avail来了解更多信息。编译器命令的实现（openmpi还是mpich2等）必须与执行程序的命令相同，即mpirun -np 2 main。 - francis
11个回答
53
几乎肯定的问题是您没有使用MPI编译器包装程序。每次编译MPI程序时，应该使用MPI包装程序：
  • C - mpicc
  • C++ - mpiCC、mpicxx、mpic++
  • FORTRAN - mpifort、mpif77、mpif90
这些包装程序为您完成所有繁琐的工作，确保在编译程序时包括所有适当的编译器标志、库、包含目录、库目录等。
1
难题在于openmpi没有mpicc、mpicxx等MPI包装器。 - Marc J. Driftmeyer
1
可能有一些实现不提供它们，但Open MPI不是其中之一。它肯定至少有mpicc、mpicxx和mpifortan。 - Wesley Bland
7
你能解释如何修复这个问题吗？我正试图编译某人的程序，但是出现了原始帖子中提到的错误。它正在寻找mpi.h文件。我使用apt-get安装了API，但仍然得到相同的错误提示。 - user391339
3
没有提供如何使用这些包装器的信息；是将它们添加到编译器中，例如使用“-mpiCC”参数，还是安装一个包装器并在源文件中包含它？ - Terry
1
@user391339 和 Romario，你们的 IDE 默认使用 cmake 或其他工具来编译 .cpp 文件，对吧？相反，你们可以使用 mpi 包装器（它只是一个编译/执行命令）来编译/执行程序。例如：$ mpic++ main.cpp，运行程序的示例为 $ mpirun -np 2 a.out。 - Hasnaa Ibraheem
52

在我的系统上，我只是缺少Linux软件包。

sudo apt install libopenmpi-dev
pip install mpi4py

（使用它的示例，是一个很好的即时测试，以查看其是否成功）

成功。

如果您在构建LAMMPS时遇到此错误，此解决方案的第一行也适用： $ cmake ../cmake
  • 运行检查基于make的构建系统生成的自动生成文件 CMake Error in /home/name/lammps-23Jun2022/build/CMakeFiles/CMakeScratch/TryCompile-Iqf2dm/CMakeLists.txt: 导入的目标"MPI::MPI_CXX"包含不存在的路径 "/usr/lib/x86_64-linux-gnu/openmpi/include"在其INTERFACE_INCLUDE_DIRECTORIES中。
 - user30850
14

你可以执行：

$ mpicc -showme

结果：

gcc -I/Users/<USER_NAME>/openmpi-2.0.1/include -L/Users/<USER_NAME>/openmpi-2.0.1/lib -lmp

这个命令会显示编译mpicc所需的必要库

例子：

$ mpicc -g  -I/Users/<USER_NAME>/openmpi-2.0.1/include -o [nameExec] [objetcs.o...] [program.c] -lm


$ mpicc -g  -I/Users/<USER_NAME>/openmpi-2.0.1/include -o example file_object.o my_program.c otherlib.o -lm

这个命令将生成一个包含你的程序的可执行文件。例如，你可以执行：

$ ./example
1
你是在建议使用包装器来提取一些信息，然后再将其传递回包装器吗？ - Gilles Gouaillardet
7
在我的Ubuntu 16.04系统上，我安装了以下内容：
sudo apt install libopenmpi-dev

我使用mpiCC进行了编译，它能正常工作。

5
如上所建议，包括

的内容

/usr/lib/openmpi/include

在包含路径中处理这个问题（在我的情况下）

对于OpenSUSE Leap，/usr/lib64/mpi/gcc/openmpi/include/。 - Max
3
Debian似乎包含以下内容：
  • mpiCC.openmpi
  • mpic++.openmpi
  • mpicc.openmpi
  • mpicxx.openmpi
  • mpif77.openmpi
  • mpif90.openmpi
我将测试每个的符号链接，以便像HDF5-openmpi启用的程序能够找到mpi.h。
纠正一下，Debian通过其替代系统包含符号链接，但仍无法在H5public.h头文件中引用的HDF5 openmpi软件包和mpi.h之间找到正确的路径。
2
在Ubuntu 18.04上，我需要安装以下内容：
sudo apt install lam4-dev
使用Open-MPI 3+或MPICH 3+，不要使用古老的Lam。 - Jeff Hammond
1
在 Fedora 上：
dnf install openmpi-devel
1

一旦您安装了MPI：

$ sudo apt install mpich

查看库的安装位置，每种情况都不同：

$ mpicc -show

在我的情况下：（Ubuntu 20.0）

然后添加...

#include </usr/lib/x86_64-linux-gnu/openmpi/include/openmpi>

:-)

1
在Ubuntu 20.04上，这对我有效：
apt -y install lam-runtime
网页内容由stack overflow 提供, 点击上面的
可以查看英文原文，
原文链接